首页/技术研究/

基因表达的稳定性和可进化性之间的平衡对于生物体的长期维持非常重要。本文中，我们研究了启动子的遗传和表观遗传特性是否对基因的表达变动性有所影响。我们假设相邻基因的方向性（首尾相连或头对头相连）以及基因上游序列的长度对启动子的结构和基因表达的变动性很重要。

基因组大小（C值，每个单倍体基因组DNA的皮克pg数）在真核生物中，最大值和最小值相差200000倍多，在动物界中相差3000多倍。绝大多数的真核生物DNA都是非编码的，暗示大的基因组不一定就有更多数量的基因(Gregory, 2004)。

最近研究发现含δ亚基的突触外受体对中低浓度的酒精敏感，提高了这些受体介导中低程度饮酒之后酒精效应（如嗜酒）的强化。我们使用病毒介导的RNA干扰技术减少成年大鼠伏隔核背中壳区域（而非壳两侧或核上）GABAA受体中δ亚基基因的表达，发现大鼠主动性饮酒量下降。

在阅读关于同义替换和非同义替换方面的文献时经常遇到这两个名称，2倍简并位点（twofold degenerate site）及4倍简并位点（fourfold degenerate site）。困惑了作者很久，现在将维基百科中的有关解释翻译成为中文以供参考，译文如下：

蛋白质编码基因中的核苷酸置换可能是同义置换也可能是非同义置换，前者不改变所编码的氨基酸，也称为沉默置换，后者则使所编码的氨基酸发生改变。通常绝大多数的非同义置换都会被纯化选择所淘汰，但是在某些情况下，达尔文选择则可能将之保留。因此研究同义置换和非同义置换的数量可以提供作用于某个系

前面我们讨论过计算两序列之间同义置换及非同义置换的经典方法——Nei and Gojobori方法（Nei et al.，1986）（参考上一篇博文“同义置换和非同义置换率（dS/dN ratio）的估计”）

以序列AY607302为例，首先打开NCBI首页…………

在系统发育的相关研究中，常常会使用线粒体基因组序列。使用其中13个蛋白质编码基因构建系统发育树几乎已经成为线粒体基因组研究的惯用手段。那么在已经公布的线粒体基因组中如何又快又准确的下载到13个蛋白质编码基因呢？下面是图解详细的操作步骤：

很多时候，我们需要在我们的科研笔记中注明某个文件的存放路径以便以后查找，例如D:\ziliao\zhuanye\JAVA\COURSE\第一课 B。在使用win7之前的windows版本时，我们只需找到目标文件，然后鼠标点选地址栏，复制即可。

我们经常遇到需要截取一条基因序列中的一段进行分析，例如线粒体全序中的某个功能基因片段。通常我们使用序列编辑软件操作，但是除了操作方法繁琐意外，还容易出错。下面我们将介绍一种使用clustalX软件截取序列片段的方法。