军事医学研究院“国家蛋白质科学中心（北京）”蛋白质组学科研平台。图片由军事医学研究院提供
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军事医学研究院“国家蛋白质科学中心(北京)”主任秦钧介绍，这种蛋白分型不依赖于任何基因组信息，体现出作为功能直接执行者的蛋白质在临床科学中所提供信息的重要性和全面性，可以为胃癌病人的精准医疗提供直接依据。
胃癌在全球肿瘤死亡原因中排名第三。数据显示，中国胃癌每年新发病例数约为68万，约占全球发病病例的一半。当前，广泛应用的Lauren分型从形态学上将胃癌分为肠型、弥漫型和混合型，其中弥漫型胃癌被称为“胃癌中的胃癌”，目前尚无有效的靶向疗法。此前，国际上发表过基于基因组和转录组的胃癌分子分型，但均未实现与临床预后的有效关联。
2012年，秦钧率领团队开启了绘制首个弥漫型胃癌蛋白质组学图谱和肿瘤驱动基因变异图谱的征程。在聚力打通胃癌蛋白质组学分析技术路线的同时，他们联合北京大学肿瘤医院开始进行大规模胃癌样品分析。
2016年6月，科研团队基本完成84对胃癌与癌旁组织样品的质谱测量工作，共鉴定出11340个不同基因产物。这些蛋白质覆盖了肿瘤细胞及肿瘤微环境所有可能表达的蛋白，从而首次描绘了弥漫型胃癌的蛋白质组全谱。
进一步研究发现，仅对84对胃癌与癌旁组织全蛋白表达谱进行聚类分析，就可将弥漫型胃癌分为3个与生存预后和化疗敏感性密切相关的分子亚型。在此基础上，科研团队还筛选出23个与预后相关的胃癌候选蛋白药物靶标。
秦钧表示，基因测序只能为肿瘤的精准医疗提供非常有限的线索，这一困惑现可在蛋白质层面上得以解决。“将来在临床上，对肿瘤进行蛋白质组分析，就可以知道这是哪一种肿瘤、能不能治好、应该采取哪种治疗方法、不应采取哪种治疗方法。
