能一劳永逸解决从SARS到Omicron乃至未来变种?发现致命冠状病毒共同特征!

2022-12-02 16:22 · 生物探索

自1965年首次分离出人冠状病毒以来,共发生过三次最致命的冠状病毒爆发。

导语:自1965年首次分离出人冠状病毒以来,共发生过三次最致命的冠状病毒爆发,包括2002年冬的非典疫情,2012年的MERS(中东呼吸综合征)疫情,以及至今尚未结束的新冠疫情,但其他的人冠状病毒仅会造成普通感冒。那么,为什么有的冠状病毒更容易引发严重疾病?布里斯托大学领导的科研人员在最近解开了这个谜题,并可能以此为契机,开发出一种能够打败当前所有甚至未来危险冠状病毒的方法。

11月23日,布里斯托大学生物化学学院的Christiane Schaffitzel教授和马克斯普朗克-布里斯托尔最小生物学中心的Imre Berger教授领导的国际研究团队在Science Advances上发表一项最新研究“The free fatty acid–binding pocket is a conserved hallmark in pathogenic β-coronavirus spike proteins from SARS-CoV to Omicron”(图1)[1]。

1669969733570584.png

图1 研究成果(图源:[1])

在研究中,这一团队对所有冠状病毒的刺突糖蛋白(spike glycoprotein)进行了仔细地检查。刺突糖蛋白简称S蛋白,可结合成蛋白三聚体装饰于冠状病毒的表面,能够与宿主细胞表面受体结合,介导病毒侵入细胞,继而引发广泛的危害。继2020年在新冠病毒的S蛋白中发现了一个“口袋”(pocket)特征后,他们这次发现,这个特别的“口袋”存在于所有致命的冠状病毒中,而那些不具有这一特征的冠状病毒,只会引起轻度的感染和类似感冒的症状。

关于这个“口袋”,研究团队在2020年就已经通过电子冷冻显微镜(electron cryo-microscopy,cryo-EM)以近原子的分辨率对新冠病毒的S蛋白进行成像,并在Oracle高性能云计算的支持下生成了3D结构。出人意料的是,他们在S蛋白的“口袋”中发现了埋藏在其中的小分子游离脂肪酸——亚油酸(linoleic acid,LA)。

640 (4).png

图2 S蛋白三聚体在电子冷冻显微镜下,橙色分子为LA(图源:[2])

LA是一种公认的必需脂肪酸,对于许多细胞功能来说都不可或缺,虽然人体不能自行合成,但可以从饮食中吸收。LA还在炎症和免疫调节中起着至关重要的作用,这两者都是新冠肺炎疾病进展的关键因素。LA还被用来维持肺部的细胞膜,使得我们能够正常呼吸。

而LA的存在,起到了闭锁S蛋白三聚体构象的作用。当S蛋白三聚体处于开放构象,将易于与宿主细胞表面的ACE2结合,而当S蛋白三聚体处于闭合构象时,处于非感染性形式,将减少与ACE2的结合。ACE2即血管紧张素转化酶2,已在2020年被确定为新冠病毒的功能性宿主受体。ACE2相当于人体细胞“大门”上的一个锁孔,给予了新冠病毒使用“钥匙”S蛋白开锁进门的可能。

使用新冠病毒感染人类上皮细胞的实验也给出了极具希望的结果,LA补充剂能够与新冠药物协同作用,抑制病毒的复制。先前利用S蛋白中类似的脂肪酸“口袋”开发出来的小分子抗病毒药物在治疗鼻病毒(一种引起普通感冒的病毒)的人体临床试验中取得了成功,病毒表面蛋白被锁定为无法与受体结合的构象。而另一项针对新冠患者血清蛋白质组学和代谢组学的研究表明,患者体内包括LA在内的游离脂肪酸水平均显著降低。

在发现“口袋”和“口袋”中的LA后,研究人员仔细审查了新冠病毒的每一个变种,包括目前最受关注的Omicron,想要知道“口袋”是否依然保留。有趣的是,Omicron发生了诸多能够帮助其逃脱疫苗免疫保护的突变,但这个“口袋”始终存在。

“当我们意识到这个口袋未曾改变时,” 研究的主要作者、生物化学学院研究助理Christine Toelzer说,“我们回过头来问,多年前爆发的SARS病毒和MERS病毒是否也拥有这样的口袋?” 结果表明,SARS病毒和MERS病毒也有这样的“口袋”,并且可以通过几乎相同的机制结合LA。

Schaffitzel教授总结道:“我们提供的证据表明,从20年前爆发的SARS病毒到今天的Omicron,所有致命冠状病毒的口袋都保持不变。而LA能够与该口袋结合,消除病毒的感染性,LA的补充也能够抑制细胞内病毒的复制。对于将来出现的危险变种,我们预计也会存在这个口袋,这是我们击败病毒的切入口。”

来, LA或LA模拟物将有望成为抗冠状病毒的可靠候选,而且,脂肪酸早已在其他药物中作为赋形剂被大量使用,多种给药途径(鼻腔、肺部、口腔和静脉)都已确定其安全性。2020年12月,Schaffitzel教授还与他人一起共同创立了公司Halo Therapeutics,目前正积极利用游离脂肪酸配方开发泛冠状病毒抗病毒药物。或许,在不久的将来,人类将像消灭天花一样,彻底摆脱冠状病毒的威胁。

640 (5).png

图3 Halo Therapeutics目前研发管线(图源:Halo Therapeutics官网)

参考资料:

[1]Toelzer C, Gupta K, Yadav SKN, et al. The free fatty acid-binding pocket is a conserved hallmark in pathogenic β-coronavirus spike proteins from SARS-CoV to Omicron. Sci Adv. 2022 Nov 25;8(47):eadc9179. doi: 10.1126/sciadv.adc9179. Epub 2022 Nov 23. PMID: 36417532.

[2]Toelzer C, Gupta K, Yadav SKN, et al. Free fatty acid binding pocket in the locked structure of SARS-CoV-2 spike protein. Science. 2020 Nov 6;370(6517):725-730. doi: 10.1126/science.abd3255. Epub 2020 Sep 21. PMID: 32958580; PMCID: PMC8050947.

关键词: 变种 冠状病毒