本文转载自生物通,原标题“南京大学发布无序列限制的DNA编辑新工具”。
内切酶经过改造可以成为强大的DNA编辑工具,比如ZFN、TALEN、风头正劲的CRISPR–Cas系统和引起争议的NgAgo技术。不过这些技术都是通过序列识别来实现靶向切割的,会受到序列偏好的限制。
南京大学的研究团队九月十五日在Genome Biology杂志上发表了一项突破性成果。他们开发了结构引导的DNA编辑新技术,不再受到靶序列的限制。这篇文章的通讯作者是南京大学医学院附属金陵医院的周国华(Guohua Zhou)研究员、南京大学模式动物研究所的赵庆顺(Qingshun Zhao)教授和朱敏生(Minsheng Zhu)教授。
FEN1(flap endonuclease-1)是一种识别3’ flap结构的内切酶。研究人员将FEN1与Fn1(Fok I)的剪切结构域结合起来,制造了结构引导的DNA编辑工具——SGN。SGN(structure-guided endonuclease)能够识别靶序列与向导DNA(gDNA)形成的3’ flap结构,通过Fn1二聚化对靶序列进行切割。研究显示,一对gDNA可以引导SGN在斑马鱼胚胎的基因组中正确切割报告基因和内源基因。这项研究指出,SGN能特异性识别和捕获目标,准确切割任何DNA序列。