高通量测序技术广泛应用于生物学、医学、农学等诸多领域,以极低的单碱基测序成本和超高的数据产出,极大地拓展了科研探索的深度和广度。然而,高通量测序产生的海量数据,如何做到高效高质量的数据挖掘,却让很多科研工作者无所适从。因此测序数据的生物信息挖掘已成为科研进步和突破的限速步骤。
以往科研工作者进行组学数据分析,多数依靠测序公司生信人员提供的标准分析结果。生信分析批量生产的模式化结果,往往难以满足不同科研数据的个性化分析诉求,很难针对性解析不同课题的科学问题。一个课题的周期多数1-3年,如果大量的宝贵时间花费在自学生信知识,或者与测序公司技术、生信人员的反复沟通和分析修改上,势必严重制约科研成果的发表速度和质量。
一款能够符合科研工作者使用需求,实现高效高质量生信数据挖掘的工具就显得尤为重要。生物信息云计算平台,无疑成为当下最佳的热门之选。但众说纷“云”,究竟什么才是真正的生信云?
第一:责任担当
科研大众与科研圈的进步需要云计算公司提供有益且有力的推动。普及生信专业知识与科研问题解决方案,提供公益学习渠道和资源,让科研工作者学会并掌握组学科研工具及方法是生物信息云计算平台的第一责任。美吉生物I-Sanger生信云平台自创立之初就将该责任列入公司发展理念,经过多年的努力和探索已经成为生物信息云计算平台的标杆企业。目前I-Sanger生信云平台可以免费注册账号,并通过云平台课堂学习课题研究思路和云平台生信挖掘操作,利用参照数据通过分析模块及工具建模,掌握信息挖掘及推演科研思路,优化课题设计,探索科学真相。根据官方数据统计,美吉生物已通过QQ交流群为超过1.5万科研人提供在线讲座培训,通过I-Sanger美吉大讲坛为超过2万人提供在线知识学习。
第二:去中心化
去中心化是互联网思维的核心思想,美吉生物I-Sanger云平台正是通过强大的交互功能不断地向科研用户赋能,让分散的每一个用户成为自己数据的主人,能够自主进行个性化的数据挖掘,毕竟最了解自身课题的还是用户本人。2016年9月,美吉生物I-Sanger生信云首款云分析流程上线,开始同时向三千多位科研用户提供微生物多样性分析服务。截止到今日,不到两年时间里,美吉I-Sanger生信云已有超过7款定制流程和众多小工具,贯穿了中心法则的主体产品,并为2万多科研工作者提供基因组学、转录组学和蛋白质组学等的生信分析和专业知识服务。去中心化的设计理念,让每位I-Sanger用户都成为了自己数据的掘金者。
第三:交互分析
交互,是指实现人与数据的直接对话,是真正意义生信云平台必备的核心属性之一。通过交互分析,用户只需根据课题设计,选择分析内容和参数设置,点击确认,即可获得自己需要的数据分析结果。科学研究,就是一个不断尝试、试错,不断接近科学真相的过程。一个课题数据的深入挖掘和解析,可能需要多达上百次的分析运算尝试,这在以往线下的交付模式下通常是难以接受的,测序公司和生信分析人员可能会厌倦或拒绝如此高频次的分析要求,但这些在I-Sanger云平台上却可以轻松且高效的实现,极大地减少了试错的成本和时间。所以,交互分析必须能够无限制地快速实现多样化分析,以期尽可能的揭示科研数据背后的真相。
任性交互在美吉生物I-Sanger云平台上表现的尤为强大,也是其有别于其他云平台的地方。市面上多数云平台更多地关注于分析流程的交互,反而忽视了再运行与可视化图表的交互,很多甚至是静态的结果呈现,显然难以满足科研工作者们的个性化分析需求。这种前重后轻的设计逻辑,严重忽略了一个事实——绝大多数用户并不精通流程分析,无需花费大量时间在分析流程的搭建上,他们更应该关注的是分析结果的解读、可视化呈现和参数选择。这正是美吉I-Sanger云平台的成功之处,准确拿捏主体科研用户需求,分析流程的搭建则交给了专业的生信分析人员进行实现。
第四:方便、快捷
方便,快捷,既是科研服务新时代的要求,也是云技术不断追求的目标。无论是在忙碌的实验期间,还是跑步运动的空当,亦或是食堂用餐的间歇,在你灵感一现的时候,拿起手机登录进入项目,即刻实现生信分析挖掘。在美吉I-Sanger云平台上,随时随地做科研,已经成为日常现实。
美吉人正不断用自己的实际行动和创造力,努力践行“让人人都成为生信专家”的愿景。美吉生物通过I-Sanger云平台树立了真正科研服务行业的新标准,必将引领科研服务开启新的篇章。