组织和细胞RNA的制备——(异硫氰酸胍法)

2010-03-07 20:10 · Truda

[试剂主要] 1.CSB缓冲液:42mM柠檬酸钠;0.83% N-lauryl sarcosine(十二烷基,N甲基甘氨酸钠);0.2 mM β-巯基乙醇。 2.变性液:异硫氰酸胍(终浓度 4 M)25g、CSB缓冲液 33ml,混合直至完全溶解,可在65℃助溶。4℃保存备用

[试剂主要]

1.CSB缓冲液:42mM柠檬酸钠;0.83% N-lauryl sarcosine(十二烷基,N甲基甘氨酸钠);0.2 mM β-巯基乙醇。

2.变性液:异硫氰酸胍(终浓度 4 M)25g、CSB缓冲液 33ml,混合直至完全溶解,可在65℃助溶。4℃保存备用。

3.2 M乙酸钠:pH 4.0。

4.异丙醇

5.无水乙醇、70%乙醇

6.酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)

7.DEPC H2O:100ml ddH2O中,加入DEPC 0.1ml,弃分振荡,37℃孵育过夜。15磅高压灭茵,4℃保存备用。

[操作步骤 ]

1.样品处理:

(1)培养细胞:收集细胞,离心,500g×5min。对于贴壁培养细胞,用0.25%胰蛋白酶-EDTA消化后,用PBS重悬细胞并转移至10ml离心管中;悬浮培养细胞可直接转移离心管;离心:500g×5min;PBS洗涤2次。弃上清,置冰浴。加预冷变性液2 ml,充分摇动,使细胞裂解完全。以下操作均在冰浴中进行。

(2)组织:取1-2g组织(新鲜或-70℃及液氮中保存的组织均可)置组织匀浆器中,加入预冷的变性液12ml,在冰浴中充分匀浆。

2.加2 M乙酸钠(pH 4.0)0.2ml,混合后将溶液转移至5ml离心管中。

3.加酚:氯仿:异戊醇2.2ml,颠倒混合用力振荡10s,冰上放置10min。

4.4℃离心,12000g×20min。

5.小心吸取上层含有RNA的水相,并转移至一新的5ml离心管中。避免吸取两相之间的蛋白物质。

6.加等体积的异丙醇,置-20℃至少30min,沉淀RNA。

7.4℃离心,12000g×15min。

8.弃上清,再加变性液2ml重悬RNA沉淀物,振荡直至RNA完全溶解(必要时可65℃水浴促溶)。

9. 加入等体积异丙醇,置-20℃ 30min。

10. 4℃离心,12000g×15min。

11. 弃上清,加入70%乙醇4ml洗涤RNA沉淀。4℃离心,8000g×5min。

12. 弃上清,将沉淀晾干。

13. 加入适量DEPC H2O溶液解RNA(65℃促溶10-15min)。

[注意事项]

1.所有实验过程均须避免Rnase的污染。

2.要避免沉淀完全干燥,否则RNA难以溶解。

附一TRIzol法

TRIzol RNA提取试剂盒是由GIBCO BRL公司推出专供提取RNA的产品,其操作方便、快捷。

[操作步骤]

1.样品处理:

(1)培养细胞:收获细胞1-5×107,移入1.5ml离心管中,加入1ml Trizol,混匀,室温静置5min。

(2)组织:取50-100mg组织(新鲜或-70℃及液氮中保存的组织均可)置1.5ml离心管中,加入1ml Trizol充分匀浆,室温静置5min。

2.加入0.2ml氯仿,振荡15s,静置2min。

3.4℃离心,12000g×15min,取上清。

4.加入0.5ml异丙醇,将管中液体轻轻混匀,室温静置10min。

5.4℃离心,12000g×10min,弃上清。

6.加入1ml 75%乙醇,轻轻洗涤沉淀。4℃,7500g×5min,弃上清。

7. 晾干,加入适量的DEPC H2O溶解(65℃促溶10-15min)。

[注意事项]

1、样品量和Trizol的加入量一定要按步骤(1)的比例,不能随意增加样品量或减少Trizol量,否则会使内源性RNase的抑制不完全,导致RNA降解。

2、实验过程必须严格防止RNsae的污染。

附二、总RNA定量

RNA定量方法与DNA定量相似。RNA在260nm波长处有最大的吸收峰。因此,可以用260nm波长分光测定RNA浓度,OD值为1相当于大约40μg/ml的单链RNA。如用1cm光径,用 ddH2O稀释DNA样品n倍并以ddH2O为空白对照,根据此时读出的OD260值即可计算出样品稀释前的浓度:

RNA(mg/ml)=40×OD260读数×稀释倍数(n)/1000

RNA纯品的OD260/OD280的比值为2.0,故根据OD260/OD280的比值可以估计RNA的纯度。若比值较低,说明有残余蛋白质存在;比值太高,则提示RNA有降解。

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