植物总RNA的快速提取与纯化

2010-03-29 20:53 · Edwiin

一、原理 RNA包括rRNA、tRNA和mRNA等,大部分通常是以核蛋白复合物的形式存在的。通过SDS、苯酚处理使蛋白质变性并沉淀。利用LiCl溶解双链DNA的特性去除DNA,经乙醇沉淀得到总RNA。纯度高、完整性好的RNA,即可用于Northern杂交、纯化mRNA、cDNA

一、原理

RNA包括rRNA、tRNA和mRNA等,大部分通常是以核蛋白复合物的形式存在的。通过SDS、苯酚处理使蛋白质变性并沉淀。利用LiCl溶解双链DNA的特性去除DNA,经乙醇沉淀得到总RNA。纯度高、完整性好的RNA,即可用于Northern杂交、纯化mRNA、cDNA合成和体外翻译等进一步的实验。

提取RNA过程中预防RNase对RNA的降解至关重要。由于RNA酶也是蛋白质,所以使所有蛋白质迅速彻底地变性同时防止了RNase对RNA的降解。可通过二乙基焦碳酸盐DEPC)处理所使用的器皿、水以及部分溶液,并在提取体系中加入RNase抑制剂等来抑制内源、外源的RNase活性。

二、目的

了解提取植物总RNA的原理和意义,掌握快速制备植物总RNA的基本方法。

三、材料、试剂

1、幼嫩的植物叶片。

2、液态氮2L。

3、Tris-Cl平衡酚(pH 8.0)。

4、苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)混合物。

5、氯仿。

6、3M NaAc(pH 5.3)。

7、RNA提取缓冲液:0.2M Tris-HCl(H 9.0), 0.4M LiCl, 25mM EDTA, 1%SDS。

8、2M LiCl。

9、0.2M Tris-HCl, pH 9.0。

10、0.4M LiCl。

11、95%乙醇。

12、75%乙醇。

13、瓷研钵。

14、无RNase的重蒸水。

四、操作方法

1、称取植物材料0.1g。

2、在瓷研钵中倒上液氮,将材料剪成小块放入液氮中,待液氮稍少时充分研磨材料,中间可补充少许液氮。

3、将粉末刮入1.5ml离心管,加入0.55ml提取液剧裂振摇2-3分钟。

4、加入0.55ml苯酚-氯仿-异戊醇混合液,振摇1分。

5、13000rpm离心10分钟。

6、将水相转到一个新的离心管中,重复第4-5步2次。

7、将水相转至新的离心管中,加入0.55ml氯仿振摇混匀,以除去痕量的苯酚。

8、13000rpm离心3-5分钟。

9、将水相转移至新离心管中,加55ul 3M NaAc(H 5.3)和2倍体积的95%乙醇。-20℃下静置20分钟。

10、4℃条件下13000rpm离心15分,用移液枪吸去上清液。

11、加0.3ml2MliCl,用移液枪轻轻吹打使双链的DNA溶解,冰浴上静置10-30分钟。13000rpm离心15分钟,弃去上清液。

12、加0.3ml无RNase的重蒸水,振摇使沉淀溶解。

13、加30ul3M NaAc(pH5.3)和0.7ml 95%乙醇,混匀。-20℃冰箱内放置20分钟,13000rpm离心15分钟。

14、弃去上清液,加入0.5ml 75%乙醇,13000rpm离心5分钟。

15、小心吸去上清液,真空干燥10分钟。

16加入50nl无RNase重蒸水重悬RNA,然后置于-20℃保存。

17、用紫外分光光度计则定260nm和280nm处的光密度。对纯的RNA来说。OD260/OD280为2.0,1OD260约为40mg/mlRNA。

18、RNA琼脂糖变性胶分析(见实验https://shiyan.ebioe.com/4316.htm)。

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