鸡基因组的PCR-RFLP分析

2010-03-15 20:45 · Prima

一、实验方法 1、鸡基因组DNA的提取 2、目的基因的PCR扩增 3、内切酶消化PCR产物 4、琼脂糖凝胶电泳(检测基因型) 鸡DNA的获取 1、鸡翅下静脉采集全血;2%EDTA抗凝; 2、DNA提取: 裂解细胞核(红细胞+白细胞) ↓ 酚-氯仿去除蛋白质

一、实验方法

1、鸡基因组DNA的提取

2、目的基因的PCR扩增

3、内切酶消化PCR产物

4、琼脂糖凝胶电泳(检测基因型)

鸡DNA的获取

1、鸡翅下静脉采集全血;2%EDTA抗凝;

2、DNA提取:

裂解细胞核(红细胞+白细胞)

酚-氯仿去除蛋白质

酶解RNA

获取DNA

PCR扩增

1、引物设计(Genbank);

2、聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)

PCR反应体系

DNA模板

dNTP

Taq DNA聚合酶

引物

Mg2+

缓冲液

PCR反应程序

预变性 94℃ 3~5min

35循环:

变性 94 ℃ 30s~1min

退火 50~65 ℃ 30~60s

延伸 72 ℃ 1~2min

后延伸 72 ℃ 5~10min

PCR产物电泳检测结果

 

 

内切酶消化PCR产物

 

 

实际操作环节>>
琼脂糖凝胶电泳检测基因型

二、实验原理
电荷效应:DNA分子在高于其等电点的pH溶液中带负电荷,在电场中向正极移动。
分子筛效应:与分子大小及构象有关,由于DNA分子或DNA片段的分子量差别,电泳后呈现迁移位置的差异。
条带类型对应于基因型。

三、实验目的>
>>>通过此实验操作,掌握琼脂糖凝胶电泳技术、DNA的分离鉴定及基因型判定方法。

四、实验材料、仪器和试剂
材料:DNA样品
仪器:电泳液、水平凝胶电泳槽、移液器、紫外透射仪、Tip头
试剂
电泳缓冲液(1×TAE):0.04mol/L三羟甲基氨基甲烷-乙酸(tris-乙酸),0.01mol/L乙二胺四乙酸二钠(EDTA)
溴化乙锭(EB10mg/ml):100ml灭菌双蒸水中加入1g EB
1%琼脂糖:100ml 1×TAE加入1g琼脂糖
上样缓冲液(溴酚蓝-甘油溶液):先配制1%的溴酚蓝水溶液与等体积的甘油即可
五、实验步骤
(一)制胶
1.将1.0g琼脂糖加至100 ml 1×TAE缓冲液中,配成1%琼脂糖。琼脂糖在微波炉中加热熔化。灌胶前将琼脂糖冷却至60。C以下。
2.加入5ul溴化乙锭(终浓度0.5ug/ ml )至熔化的琼脂糖液中混匀,但避免出现气泡。
3.准备好凝胶成型器。
4.将冷却的琼脂糖倾入用凝胶成型器,制备凝胶。
5.在凝胶一侧放入成型梳,将梳子夹在胶上方的桥上,并保证梳齿在塑料板稍上一点,但不要接触塑料板。
6.待胶变硬,直到它呈乳白状且不透明(约20分钟),轻轻去除梳子。配制2L 1×TAE缓冲液,用于电泳槽。将缓冲液到入洁净的凝胶槽。
(二)电泳
1.将凝胶塑料板水平放置在电泳槽中。
2.凝胶应完全侵入缓冲液,但覆盖的缓冲液不要超过1cm。
3.取5ul样品加入上样缓冲液,小心的将样品加入每一样品槽内
4.接通电源,电压4-5V/cm,DNA从负极移到正极。时间30-40分钟。
5.关掉电源,结束电泳。

六、结果分析>
>1.>将电泳完毕的琼脂糖凝胶置于自动成像系统的平台中间>>
2.开通紫外光,在电脑中观察图像;>>
3.关上紫外光电源,在电脑中编辑和保存图像;>>
4.根据图像结果判定不同个体基因型。

 

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