徐 丽 蔡俊鹏
(华南理工大学食品与生物工程学院,广东广州510640)
摘 要:为建立一种快速、经济、敏感的PCR检测方法,以直接检测出环境、海产品等中的靶基因,通过PCR扩增已知携带tlh和tdh基因的副溶血弧茵标准菌株,并和常规PCR方法比较,初步建立了茵落PCR技术;再以副溶血弧茵标准菌株为阳性对照,以本实验室自海洋环境中分离得到的数株野生菌株为检测对象,采用新建立的茵落PCR 以及常规PCR 方法对它们进行扩增比较,进一步证明了茵落PCR技术检测携带相关基因菌株的可靠性.通过比较,发现茵落PCR和常规PCR的结果相当一致,两种方法均能扩增出阳性对照标准菌株中tlh和tdh基因. 关键词:茵落PCR;常规PCR;tdh基因;tlh基因
PCR是一种快速、特异性地扩增某片段DNA 的分子生物学技术,自其发明以来,已在国际上得到了广泛的应用.常规PCR扩增前需制备、纯化DNA 模板,其方法主要有酸酚法、碱酚法、碱性SDS裂解法、CsC1 一溴化乙锭密度梯度离心法和煮沸裂解法等-- .它们各有优缺点,有的操作较繁,难度大;有的则成本较高.例如,酚一氯仿抽提法是一种经典方法,这种方法需要通过蛋白酶K 的消化及有机试剂酚、氯仿的抽提,而最终获得基因组DNA.这种方法虽可以获得质量较高的DNA,但操作繁琐,耗时较长,且需要昂贵的试剂及一些特殊处理.同时在反复的操作中DNA量损失也较大,产率较低,故需要较多量的菌种材料.另外,一些试剂本身如酚、氯仿等不仅对DNA有害,而且如果残留,也会对PCR反应中的Taq酶产生抑制作用 .
菌落PCR 方法最早见于D.Gussow 和T. Clackson 的文章.他们提到,用无菌牙签挑取单个菌落到TE缓冲液中,煮沸5min,漩涡振荡后短暂离心,用1~2 L裂解液作为DNA模板.省去抽提模板DNA这一步,节省了大量时间和实验成本,不失为一种经济、快速、准确的好方法
本实验采用的菌落PCR方法,将样品跳过DNA 抽提这一步,而直接以菌体热、冻解后暴露的DNA 为模板进行PCR扩增,不仅节约了时间,增加了设备利用率,同时也降低了实验成本.本实验采用副溶血弧菌的不耐热溶血素(tlh基因)和耐热的直接溶血素(tdh基因)作为扩增对象.不耐热性溶血毒素 (Thermolabile hemolysin,简称tlh)是副溶血弧菌产生的毒素之一,tlh不但溶解人的红细胞,而且溶解马的红细胞,生化实验证明tlh是一种非典型的磷脂酶,但其功能和致病性仍不清楚 .耐热的直接溶血 tdh基因是目前公认的副溶血弧菌的主要致病因子,它一般存在于对人体有致病性的副溶血弧菌中。
本研究使用常规PCR和菌落PCR对其进行扩增,并以其为阳性对照,对其他几株菌株是否含有该两靶基因进行检测,分别作了介绍.