材料:
(1)急性期病人血清、鼠肺、鼠血或分离的汉坦病毒
(2)引物:
引物
序列(5’~3’)
位置
片段(bp)
逆转录引物
TAGTAGTAGACTCC
1~14
LMS
通用外引物
AAAGTAGGTGITAYATCYTIACAATGTGG
1910~1939
M(+)
GTACAICCTGTRCCIACCCC
2373~2354
M(-)
型特异性引物
汉滩病毒
GAATCGATACTGTGGGCTGCAAGTGC
1958~1984
M(+)
GGATTAGAACCCCAGCTCGTCTC
2318~2340
M(-)
汉城病毒
GTGGACTCTTCTTCTCATTATT
1936~1957
M(+)
TGGGCAATCTGGGGGGTTGCATG
2331~2353
M(-)
S片段引物
ATGTTGCCTGGGGIAAAGAGG
1200~1220
S(+)
GCGCACTAGTAGTAGTAGACTCCCTAAAGA
1670~1696
S(-)
方法:
(1)病毒RNA的提取:采用TRIzol按说明提取,制备模板RNA;
(2)逆转录、合成cDNA:采用 SuperScripTMII或AMV逆转录酶,按说明书进行;
(3)PCR扩增:反应条件为95℃预变性10分钟,94℃60秒、55℃60 秒、72℃45秒、扩增30~35个循环,72℃延伸12分钟。
(4)扩增产物用1~2%琼脂糖凝胶电泳鉴定。若条带的分子量与预期片段大小相同,则表明为特异性扩增产物。
必要时,可进行:
(5)PCR片段的回收和核苷酸序列测定:切下特异分子量条带,用QIAquick凝胶回收试剂盒回收(按其说明书进行),自动测序仪测序。
意义:扩增到特异性条带可确诊汉坦病毒并明确其型别,序列测定还可以对汉坦病毒的变异情况进行研究。