主要内容
RT-PCR原理
RT-PCR步骤
常见问题分析
两步法RT-PCR
一步法RT-PCR
两步法与一步法RT-PCR比较
RT-PCR主要用途
分析基因的转录水平
获取目的基因
合成cDNA探针
逆转录酶的选择
AMV:
禽成髓细胞瘤病毒,逆转录酶和RNA酶H活性。最适42℃,最新版本可达60 ℃ (Bioflux公司)。
MMLV:
Moloney 鼠白血病病毒,逆转录酶,RNA酶H活性较弱。最适37℃,最新版本42 ℃(赛百盛)
Super RNaseH- Reverse Transcriptase
MMLV反转录酶的RNase H-突变体,它能将更大部分的RNA转换成cDNA,最适42℃。(Tiangen天根生化)
RNase H的作用
水解RNA-DNA杂合链中的RNA
RT- PCR引物的选择
随机引物:
适用于长的或具有发卡 结构的RNA,特异性最低。起始浓度范围为20µl体系50-250µg。
Oligo(dT15-18):
适用于具有PolyA尾巴的RNA。起始浓度范围为20µl体系0.2-0.5µg。
特异性引物:
与目的序列互补,是反义寡核苷酸,适用于目的序列已知的情况。起始浓度范围为20µl体系1pmol。
提高RT-PCR灵敏度
1. 分离高质量RNA
2.使用无RNaseH活性的逆转录酶
3.提高逆转录酶保温温度
4.减少基因组DNA污染
RT常见问题