Rt-PCR实验准备及与操作步骤

2010-03-13 10:23 · Hunter

一、实验器具与材料: 1、移液枪:1ml、200μl、20μl、10μl、2μl 2、吸头:1ml、200μl、20μl 3、匀浆管:5ml 4、吸头台:放置1ml吸头的一个,放置20μl吸头的一个 5、EP 管:1.5ml、0.2ml、100μl 6、试剂瓶:2个6

一、实验器具与材料:

1、移液枪:1ml、200μl、20μl、10μl、2μl

2、吸头:1ml、200μl、20μl

3、匀浆管:5ml

4、吸头台:放置1ml吸头的一个,放置20μl吸头的一个

5、EP 管:1.5ml、0.2ml、100μl

6、试剂瓶:2个60ml的棕色试剂瓶(广口,带盖)

1个125ml的白色试剂瓶(放无水乙醇)

7、量筒:50ml、250ml、500ml

8、容量瓶:250ml、500ml、1000ml

9、试管架:5ml、 1.5ml、20μl

10、盐水瓶:250ml、500ml各2个备用,一个装无水乙醇,另一个装DEPC水

11、铝制饭盒:4个

12、塑料小饭盒:1个

13、大瓷缸:2个

14、锡泊纸:一卷

15、卷纸:2卷

16、三角烧瓶:带盖,稍大

易生物仪器库:https://www.ebioe.com/yp/product-list-42.html

易生物试剂库:https://www.ebioe.com/yp/product-list-43.html

二、实验器具的处理与准备

1、塑料制品:(包括枪头、EP管、匀浆管等)

先将DEPC水从容量瓶中倒入瓷缸中,将塑料制品逐个浸泡其中,其中小枪头需要吸管打入DEPC水,过夜,然后高压,再烤干备用,实验前将枪头等放入吸头台,再高压一次(EP管)

2、玻璃制品:泡酸过夜,冲洗干净,蒙锡纸烤干备用(DEPC水泡)(洗净后先泡1‰DEPC过夜,再烤干)

3、匀浆器:(包括剪刀、镊子)先洗净后,再高压(不需要泡DEPC)

三、试剂配制:

1、DEPC水:吸出1ml放在1000ml双蒸水中配成1‰DEPC水,放在1000ml容量瓶中静置4小时备用。

2、75%乙醇:用无水乙醇+DEPC水配,然后放-20℃保存(其中DEPC 水需先高压)

3、异丙醇:放入棕色瓶中

4、氯仿:放入棕色瓶中

5、琼脂糖

四、几种缓冲液的配制:

1、电泳缓冲液:

Tris 54g

硼酸 27.5g

0.5M EDTA 20ml? pH8.0

蒸溜水 1000ml

5×TBE (贮存液)

再将5×TBE稀释10倍成0.5TBE就可以在电泳时使用(即工作液浓度),如取50ml贮存液+450ml水--→500ml工作缓冲液

2、上样缓冲液:

0.25%溴酚蓝

0.25%二甲苯青FF

30%甘油

6×缓冲液,4℃保存

五、琼脂糖凝胶的配制:

1、 1.0%:

1.0g琼脂糖+100ml电泳缓冲液,微波炉中火30秒至沸腾,熔化的琼脂物冷却至60℃时加入10mg/ml溴化乙锭 2.5μl,充分混匀,将温热的凝胶倒入已置好梳子的胶膜中,在室温下放置30-45min后现进行电泳。

2、1.5%:

同上,将琼脂糖的量改为1.5g


一、实验器具与材料:

1、移液枪:1ml、200μl、20μl、10μl、2μl

2、吸头:1ml、200μl、20μl

3、匀浆管:5ml

4、吸头台:放置1ml吸头的一个,放置20μl吸头的一个

5、EP 管:1.5ml、0.2ml、100μl

6、试剂瓶:2个60ml的棕色试剂瓶(广口,带盖)

1个125ml的白色试剂瓶(放无水乙醇)

7、量筒:50ml、250ml、500ml

8、容量瓶:250ml、500ml、1000ml

9、试管架:5ml、 1.5ml、20μl

10、盐水瓶:250ml、500ml各2个备用,一个装无水乙醇,另一个装DEPC水

11、铝制饭盒:4个

12、塑料小饭盒:1个

13、大瓷缸:2个

14、锡泊纸:一卷

15、卷纸:2卷

16、三角烧瓶:带盖,稍大

易生物仪器库:https://www.ebioe.com/yp/product-list-42.html

易生物试剂库:https://www.ebioe.com/yp/product-list-43.html

二、实验器具的处理与准备

1、塑料制品:(包括枪头、EP管、匀浆管等)

先将DEPC水从容量瓶中倒入瓷缸中,将塑料制品逐个浸泡其中,其中小枪头需要吸管打入DEPC水,过夜,然后高压,再烤干备用,实验前将枪头等放入吸头台,再高压一次(EP管)

2、玻璃制品:泡酸过夜,冲洗干净,蒙锡纸烤干备用(DEPC水泡)(洗净后先泡1‰DEPC过夜,再烤干)

3、匀浆器:(包括剪刀、镊子)先洗净后,再高压(不需要泡DEPC)

三、试剂配制:

1、DEPC水:吸出1ml放在1000ml双蒸水中配成1‰DEPC水,放在1000ml容量瓶中静置4小时备用。

2、75%乙醇:用无水乙醇+DEPC水配,然后放-20℃保存(其中DEPC 水需先高压)

3、异丙醇:放入棕色瓶中

4、氯仿:放入棕色瓶中

5、琼脂糖

四、几种缓冲液的配制:

1、电泳缓冲液:

Tris 54g

硼酸 27.5g

0.5M EDTA 20ml? pH8.0

蒸溜水 1000ml

5×TBE (贮存液)

再将5×TBE稀释10倍成0.5TBE就可以在电泳时使用(即工作液浓度),如取50ml贮存液+450ml水--→500ml工作缓冲液

2、上样缓冲液:

0.25%溴酚蓝

0.25%二甲苯青FF

30%甘油

6×缓冲液,4℃保存

五、琼脂糖凝胶的配制:

1、 1.0%:

1.0g琼脂糖+100ml电泳缓冲液,微波炉中火30秒至沸腾,熔化的琼脂物冷却至60℃时加入10mg/ml溴化乙锭 2.5μl,充分混匀,将温热的凝胶倒入已置好梳子的胶膜中,在室温下放置30-45min后现进行电泳。

2、1.5%:

同上,将琼脂糖的量改为1.5g


六、需购置的Rt-PCR材料:

(生工. Tel. 2236106.)

Taq酶(含MgCl2 Buffer) 200u 70.00

dNTP: 1支

oligo(dT)15: 1 OD 40.00 promega

M-MLV: 1支 250.00 promega (Buffer)

RNasin: 1支 110

-- -20℃

DEPC 5g 110.00

Trizol 100ml/1瓶 Invitrogen Life technologies

-- 4℃

Marker: 10μg 0.2μg/ml 150.00 科威

(1543. 994. 697. 515. 377. 231)

七、引物合成

正义:5′-CACGATGGAGGGGCCGGACTCATC-3′

反义:5′-TAAAGACCTCTATGCCAACACAGT-3′

2、 par-4:

正义:5′-GGGACCTCGGAACTCAAC-3′

反义:5′-TGTATCTGCCTGGGACTG-3′

3、退火温度计算

2(A+T)+4(G+C)

正反义平均数,再上下波动度(±4℃,或±5℃)

4、引物各合成5 OD,每OD一瓶分装好

5、引物稀释:

加DEPC水量为(μl)

= ? nmol / OD × 管上所标OD数×100

是为10p mol / μl 浓度的引物溶液

八、PCR产物电泳

先将1-10μl左右PCR产物,加已点在纸上的溴酸兰,反复吸打混匀后进行电泳,一般电流为10mA,电源100V,电泳30分钟,紫外灯下观察,满意的结果扫描打印。

九、几个注意点:

1、逆转录的关键步骤是立即冰水浴?

2、Rt时,先打开PCR预热30分钟。

3、RNA抽提前,打开离心机预冷。

TRIzol法抽提总RNA

细胞1×107

组织100mg

加1mlTRIzol

细胞用1ml加样器吹至液体澄清且无细胞团块

匀浆(要彻底,后转至EP管)

(组织匀浆量<100mg时分装1ml/每EP管)

颠倒混匀10下,室温5分钟

加氯仿1/5体积(0.2ml)(必须按总体积的1/5)

颠倒混匀10下,室温5分钟

4℃,离心12000g,15分钟

转上层水相(约400μl)于另一1.5mlEP管中

加等体积异丙醇(约400μl),混匀室温10分钟

4℃,离心12000g,10分钟

弃上清

加冰预冷的75%乙醇(用DEPC水配)1ml

4℃ 离心7500g,5分钟

弃上清,空气干燥5-10分钟(不能完全干燥)

溶于DEPC水中至 20μl(10μl-20μl)

(可在55-60℃水中,&10分钟助溶)


注:

1、RNA若用于核酸转移应溶解于样本缓冲液中,否则DEPC溶解

2、细胞组织加TRIzol匀浆后,可在-60℃放置至少一个月(甚至可一年以上)

3、RNA在75%乙醇中,2-8℃至少可保存一周,-20℃至少可保存一年

两步法RT-PCR

(第一步:逆转录反应)

试剂 浓度 体积 终浓度

RNA 23μl(11.5μl)

Oligo(dT)15 0.05μg/μl 4μl(2μl) 0.005μg/μl

(稀释10倍后用)

混匀,离心,70℃ 5min

立即冰水浴,稍离心

试剂 浓度 体积 终浓度

M-MLV Buffer 5× 8μl (4μl) 1×

dNTP 10mM 2μl (1μl) 0.5mM

RNasin 40U/μl 1μl (0.5μl) 20μ

M-MLV 200U/μl 2μl (1μl) 200U

总体积40μl(20μl)

混匀,离心,42℃ 60min

95℃ 10min(破坏MLV)

4℃保存

两步法RT-PCR

(第二步:PCR反应)

总体积20μl(50μl)

试剂 浓度 体积 终浓度

Taq Buffer 10× 2μl (5μl_) 1×

MgCl2 25mM 1.2μl (3μl) 1.5mM

dNTP 10mM 0.2μl (0.5μl) &200uM

上游引物 10pmol/μl 0.3μl (1μl) 10pmol

下游引物 10pmol/μl 0.3μl (1μl) 10pmol

cDNA 模板 X (?) (1-10μl)

DEPC水 20μl-4.3μl-X

Taq酶 2.5U/μl 0.3μl (1μl) 2.5U/μl

混匀

97℃,5分钟

立即冰水浴

混匀

95℃ 5分 预变性

94℃ 30秒 变性

X℃ 40秒 退火

72℃ 30秒 延伸

72℃ 7分 终末延伸

28-36循环,4℃保温

三、电泳:

加1-10μl PCR产物+溴芬兰(1-2.5μl)混匀,加样,电泳。

注意:Taq酶、M-MLV、Rnasin等-20℃保存,操作时置于冰上。DNTP勿反复冻融。

易生物实验技术频道 - 生物实验技术资料库!https://shiyan.ebioe.com

PCR 实验技术交流论坛:https://bbs.bbioo.com/forum-143-1.html

关键词: