临床PCR试剂盒的选用和质检

2010-03-22 12:00 · Dave

PCR或RT-PCR试剂盒的组成 核酸提取试剂 核酸扩增或逆转录-核酸扩增试剂 产物检测试剂(有些使用全自动分析仪的PCR方法因其核酸扩增和检测同时完成,故无专门的产物检测试剂) 影响PCR试剂盒质量的因素 内在因素: 原材料、核酸提取方法、方法学设计 影响PCR试剂

PCR或RT-PCR试剂盒的组成

核酸提取试剂

核酸扩增或逆转录-核酸扩增试剂

产物检测试剂(有些使用全自动分析仪的PCR方法因其核酸扩增和检测同时完成,故无专门的产物检测试剂)

影响PCR试剂盒质量的因素

内在因素: 原材料、核酸提取方法、方法学设计

影响PCR试剂盒质量的因素: 扩增所需的原材料

寡核苷酸引物和探针

缓冲液和dNTP

聚合酶、逆转录酶等

PCR反应混合物

寡核苷酸引物和探针

其对试剂盒质量的影响首先是纯度。纯度的判断可根据260/280吸光度比值来判断,如‹2.0,则需重新纯化。另一种方法是将其在聚丙烯酰胺凝胶上电泳,如出现一条以上的带或迁移位置错误,则需重新纯化。

是否有污染。

结合特异性(浓度)

dNTP和缓冲液

dNTP(包括dATP 、dCTP、 dGTP和 dTTP或 dUTP)的浓度

缓冲液:在储存和扩增循环中稳定、作为聚合酶活性所必须的Mg++(或用于rTth的Mn++)的浓度以及pH等

逆转录酶、DNA聚合酶

酶的浓度

酶的活性

核酸扩增方法

PCR

RT-PCR

转录依赖的扩增(TMA)

连接酶链反应(LCR)

链替代扩增(SDA)等

影响PCR试剂盒质量的因素: 核酸提取

核酸提取的有效性

核酸提取的简便性

影响PCR试剂盒质量的因素: 产物检测

杂交固相

特异探针及其标记物

影响PCR试剂盒质量的因素

内在因素: 原材料、核酸提取方法、方法学设计

外在因素:试剂盒的运输和贮存外在因素:试剂盒的运输和贮存

试剂盒的运输和贮存

PCR试剂盒的有效期一般为6个月,这是指在适当的贮存温度下。核酸扩增部分的试剂一般要贮存于-20℃下;产物检测部分试剂则贮存于2~8℃。

试剂盒从厂家到用户手中,均要经历运输及运输中的贮存,任一环节的不当,均会影响试剂盒的临床使用质量。

PCR试剂盒的分类

定性测定:PCR-ELISA、PCR-膜上杂交(杂交梳)、荧光PCR(分子信标和Taq Man等)

定量测定: PCR-ELISA 、Taq Man和Amplisensor荧光定量、 Amplicor PCR-ELISA定量等。

PCR试剂盒的选用原则

参考试剂生产厂家的信息广告

参考同行对有关试剂盒的使用效果

参考有关机构的综合评价

根据使用目的

根据所在实验室的技术特点

根据所在医院患者的承受能力

PCR试剂盒的质检

外包装:厂家名称、检测目的、批准文号、批号和有效期等。

内包装:试剂瓶是否漏液、真空包装是否破损以、试剂是否齐全以及是否有使用说明书等。

PCR试剂盒的质检

采用血清(样本)盘(Panel)质检: PCR试剂血清(样本)盘由一定数量的原血清阴、阳性样本、2~3份纯化核酸(DNA或RNA或cDNA)样本以及3~5份系列稀释阳性样本所组成。样本总数可定在20份左右。

原血清样本用于判断试剂盒对特定病原体核酸检出的特异性、灵敏度和符合率;纯化核酸样本用于判断DNA扩增或逆转录及DNA扩增的有效性;系列稀释阳性样本用于判断试剂的测定下限。

试剂特异性、灵敏度和符合率计 算 公 式:

试剂特异性、灵敏度和符合率计 算 公 式

灵敏度(%)= (a / a+c)

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