核酸的电泳与检测

2010-03-04 19:56 · Adam

【实验目的】 (1)了解核酸琼脂糖凝胶电泳的原理,学会其具体的操作程序。 (2)对提取的DNA进行检测,掌握紫外电泳图谱的观察分析方法。 【实验原理】 琼脂糖凝胶电泳是一种非常简便、快速、最常用的分离纯化和鉴定核酸的方法。带电荷的物质在电场中的定向运动称为电泳,核酸分子是

【实验目的】

(1)了解核酸琼脂糖凝胶电泳的原理,学会其具体的操作程序。

(2)对提取的DNA进行检测,掌握紫外电泳图谱的观察分析方法。

【实验原理】

琼脂糖凝胶电泳是一种非常简便、快速、最常用的分离纯化和鉴定核酸的方法。带电荷的物质在电场中的定向运动称为电泳,核酸分子是两性解离分子,在pH8.0时,DNA分子带负电荷在电场中向正极移动。采用琼脂糖凝胶介质作为电泳支持物,长度不同的DNA分子由于受凝胶阻遏作用大小不一,迁移速度不同,从而达到有效分离DNA的目的。

【仪器、材料、试剂】

(一)仪器

1.电泳装置:电泳仪、水平电泳槽、梳子、制胶槽

2.紫外观察:凝胶成像系统

3.高速离心机

(二)材料

1.琼脂糖

2.三羟甲基氨基甲烷(Tris)

3.硼酸

4.乙二胺四乙酸(EDTA)

5.溴酚蓝

6.蔗糖

7.溴化乙锭(EB)

8.DNA Marker(λDNA)

9.称量纸、容量瓶、瓷盘、一次性手套、取液器、三角瓶、量筒(100mL)、Tip头(10uL)、胶带

(三)试剂配制[www.bbioo.com]

1.5×TBE(pH8.0)(电泳缓冲液) 1000 ml

配制方法:

称取Tris 54g、硼酸 27.5 g,再加入20ml的0.5mol/LEDTA加三蒸水定容至

1000ml摇匀后,转到准备好的输液瓶中,贴上标签,高压灭菌后,降至室温,4℃保存备用。

2.凝胶加样缓冲液(6×)(指示剂) 100 ml

称取溴酚蓝0.25 g、蔗糖40 g然后加入三蒸水定容至100ml摇匀后,4℃保存备用。

【实验步骤】

(一)、制胶

1.称取0.4g(适量)琼脂糖置于三角瓶中,加入50ml 0.5×TBE缓冲液。

2.微波炉加热,煮沸、振摇,反复加热、振摇2-3次,使琼脂糖充分融化。

3.胶带将胶床两端粘好,底部粘严,以防凝胶渗漏,插好梳子。

4.待胶冷却至60℃左右时,将融化的琼脂糖小心地倒入胶床中,速度要快,让 胶自然冷却至完全凝固(约需要20-30分钟)。

5. 小心向上方拔出梳子,避免前后左右摇晃,以防破坏胶面及加样孔,去掉制胶槽两边的胶带,小心将胶和胶床放入电泳槽中,样品孔在阴极端。

6. 向电泳槽中加入0.5×TBE电泳缓冲液,液面高于胶面约1-2mm。

(二)、上样电泳

1、取2μl上样液(溴酚蓝指示剂)于 Parafilm上,加2μl水与2μl样品DNA反复吹吸,混匀。

2、Tip头垂直伸入液面下胶孔中,小心上样于孔中。

3、接通电源,打开高压开关,电泳开始以正、负极铂金丝有气泡出现为准。

4、根据指示剂迁移的位置,判断是否中止电泳。切断电源后,再取出凝胶。

5、凝胶取出后于含EB的溶液中染色20分钟。

(三)、凝胶紫外观察:

染色后的凝胶取出于紫外监测仪或凝胶成像系统中观察,照相,保存,记录结果。

【注意事项】

1. 琼脂糖融化时,档位不宜太高。

2. 制胶和加样过程中要防治气泡的产生。

3. EB具有强诱变性,可致癌。必须戴手套操作,严格注意防护。

4. 加样时,Tip头不宜插入样品孔太深,也不要穿破胶孔壁,否则样品渗漏或

DNA 带型不整齐。

5. 电源接通时,应核实凝胶的方向是否正确。

6. 电泳仪有电压显示,并不一定标志电泳槽已接通,应观察电极气泡出现情况。

负极的气泡比正极多一倍,表示电泳已开始。

7. 溴化乙锭可插入到DNA分子的双链中,在紫外光的照射下,插入溴化乙锭的DNA呈橙红色荧光,所以溴化乙锭可以作为荧光指示剂指示DNA含量和位置。

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