Southern技术是指以Southern名字命名的DNA转移杂交技术。它可用于基因组特定DNA序列的定位，可以测定相关片段的同源性、可以从c库、基因组文库中筛选完整基因等。用一种或多种限制性内切酶对基因组DNA加以切割，通过琼脂糖凝胶电泳分离酶切片段，随后，使DNA在原位变性，并从凝胶转移至固相膜，用已知核苷酸片段加以标记作为探针，通过分子杂交来检测待测样品中是否存在互补的核酸序列。该技术已成为分子生物学中一类重要的检测手段。下面分别介绍利用光敏生物素试剂盒及DIG试剂盒进行杂交的方法。
十五－1:光敏生物素试剂盒杂交实验
一仪器：分子杂交仪、摇床、 烤箱、取液器、电泳仪、电泳槽
二试剂：硫酸葡聚糖钠盐(可不用)、聚乙烯吡赂啉酮（PVP）、聚蔗糖、牛血清白蛋白（BSA）、100mM EDTA、3MnaAC、无水乙醇、电泳缓冲液、切变性鲱鱼精DNA（100ug/ml）
20×SSC溶液 氯化钠 ３Ｍ 预杂交液 ６×SSC
柠檬酸三钠 0.3M （含100ug/ul变性鲱鱼精DNA）
pH 7.0 ５×Denhardt's 溶液
0.5%SDS
变性液 0.5M NaOH 中和液 1M Tris-HCL pH 7.4
1.5M NaCL 1.5M NaCL
封闭液 3gBSA溶于70ml水中，浓盐酸调pH至3.0,煮沸20分钟后，冷至室温，NaOH调pH至7.5,加入10ml以下缓冲液（1M Tris-HCL pH7.5, MgCL2 0.19%, NaCL 5.8%, Triton X-100 0.05ml）定容至100ml
５０×Denhardt's 溶液 1％PVP 1M PBS NaCL 0.8% pH 7.4
1%BSA KCL 0.02%
1%聚蔗糖 Na2HPO4 0.144%
KH2PO4 0.024%
洗涤液
Ａ:２×SSC,250ml中含0.1%SDS Ｂ：0.1×SSC,250ml中含0.1%SDS
Ｃ：Tris-HCL 100mM pH 7.5 Ｄ：Tris-HCL 100mM
NaCL 1M NaCL 0.5M
MgCL2 2mM Tween 20 0.5% pH 7.5
Triton X-100 0.05%
亲和素－碱性磷酸酶溶液 Tris-HCL 100mM
NaCL 1M
MgCL2 2mM
Triton X-100 0.05%
pH 7.5
碱性磷酸酶 2-3单位/ml
底物溶液 Tris-HCL 100mM pH 9.5 终止液
NaCL 100mM Tris-HCL 10mM
MgCL2 5mM EDTA 1mM
三：操作
(一)转膜
1电泳
2切胶 在紫外下，切取凝胶有条带部分
3脱嘌啉0.25NHCL浸泡凝胶10分钟，蒸馏水洗胶（大于15kb的DNA片段转移时做此步骤）
4变性，变性液（0.5MNaOH、1.5MNaCL）浸泡凝胶2次，每次15分钟，蒸馏水洗胶
5中和,中和液（0.5Mtris-HCL,pH7.0、3MnaCL）浸泡凝胶2次，每次15分钟，蒸馏水洗胶
6平衡，凝胶在20×SSC中室温平衡10分钟
7转膜,取一塑料盒,将一干净玻璃板横架于盒上，盒中倒入10×SSC，作为转移缓冲液，将2张大小合适的滤纸用20×SSC溶液浸湿，放置于玻璃板上，作为滤纸桥
将处理好的凝胶切去多余部分并切下一角作标记，胶面反转放置于滤纸桥上，四周用Parafilm膜封闭，以防短路
剪取一块面积稍大于凝胶的硝酸纤维素膜（NC膜），以2×SSC溶液浸湿后置于凝胶上
剪取2块相应大小的滤纸，以2×SSC溶液浸湿后置于NC膜上
（滤纸、凝胶、NC膜、滤纸间都不能有气泡）
滤纸上面放一叠吸水纸，上面压一块玻璃板，再压上500g左右的重物，转移过夜
8烤膜，转移结束后，NC膜在与凝胶切角相对处，用铅笔做记号，用6×SSC溶液室温漂洗5分钟，以充分洗去沾上的凝胶成分，吸水纸吸干残余液体，室温晾干，NC膜用滤纸夹裹好，80℃烤膜2小时
9烤干的NC膜用２×SSC浸润。
注：
1：在７操作中每层间应确保无汽泡存在。
2：操作中吸水纸的大小应小于顶层滤纸，且不能于滤纸下的任何一层接触。
3：烤片的作用在于使已转移条带更牢地结合于NC膜上。
（二）杂交
1封闭，将杂交好的NC膜用滤纸吸干，放入一新杂交袋中，用封闭液４２℃封闭２－４小时（封闭液用量为４ml/50cm2膜）。
2预杂交，将上部浸润的NC膜装入杂交袋，加入预杂交液（0.2ml/cm2膜），使膜与预杂交液充分混匀，赶走汽泡，封口。65℃２－４小时。
3杂交，倾出预杂交液，加入杂交液（预杂交液＋临用前变性的标记好探针，终浓度为1-2ng/ml）（0.2ml/cm2膜），65℃过夜。
4洗膜，用洗涤液Ａ，Ｂ分别洗膜两次，每次洗膜液体积不少于250ml。
5反应，弃去封闭液，加入亲和素－碱性磷酸酶溶液，室温避光反应１５分钟，轻轻震荡。取出膜，用洗涤液Ｃ，Ｄ分别洗涤三次，每次洗涤体积不应少于300ml，每次5分钟，振荡。
6显色，将膜转入新袋中，加入底物溶液（用量为４ml/50cm2膜）。封袋，避光放置，显色数分钟至数小时，以杂交带清晰，背景低为好。
十五－2:DIG试剂盒杂交实验
一仪器：同十五－1
二试剂： 变性液：0.5MNaOH、1.5MnaCL
中和液：0.5Mtris-HCL,pH7.0、3MnaCL
20×SSC溶液（同十七－1）
预杂交液：Blocking溶液（试剂盒带）
杂交液（含5-25ng/ml，DIG标记探针的预杂交液）
low stringence buffer(2×SSC，0.1%SDS)
high stringence buffer(0.5×SSC，0.1%SDS)
洗涤液（0.1M马来酸，0.15MNaCL,pH7.5,0.3%Tween-20,）
抗体溶液（含1/5000的DIG标记碱磷酶的Blocking溶液）
平衡液（0.1MTris-HCL,0.1MNaCL pH 9.5）
显色液（平衡液中含2％BCIP/NBT储存液）
BCIP/NBT储存液(试剂盒带)
三：操作
(一)转膜 同十五－1
（二）杂交
1预杂交，将烤好的NC膜放入一个比膜稍大的塑料袋中，按100cm2/10ml的比例加入适量的预杂交液，赶走气泡，封口机封口，42℃预杂交30分钟
2杂交，倒掉预杂交液，按100cm2/10ml加入杂交液，42℃杂交过夜
（三）检测
1准备好一个塑料盒，放入100mllow stringence buffer，将杂交后的NC膜取出，置于上述溶液中，室温晃动5分钟
2取新鲜的low stringence buffer,重复上述操作一次
3将NC膜取出，置于65℃预热的100ml high stringence buffer,65℃晃动15分钟
4取新鲜的high stringence buffer,重复操作一次
5将NC膜转移至塑料盒中，内含洗涤液，室温晃动2分钟，倒掉洗涤液。
6加入100mlBlocking溶液，室温晃动30分钟，以除去没有特异结合的探针，倒掉Blocking溶液
7加入20ml抗体溶液，室温晃动30分钟，倒掉溶液
8用洗涤液室温晃动洗涤2次，每次15分钟，以除去多余的抗体，倒掉洗涤液
9平衡，加入20ml平衡液，室温放置3分钟，倒掉平衡液
10显色，加入10ml显色液，显色，目标条带显色后用50mlTE终止反应。
