DNA提取(所需溶液配制和血液基因组DNA的提取)

2010-03-18 12:20 · Eileen

所需溶液配制 (1)TE缓冲液:10mM Tris×Cl,1mM EDTA,pH 8.0,高压灭菌。 (2)1M Tris×Cl:121.14g Tris碱溶于800ml双蒸水中,用盐酸 调pH值至8.0,定容至1000ml,高压灭菌。 (3)0.5M EDTA:186.

所需溶液配制

(1)TE缓冲液:10mM Tris×Cl,1mM EDTA,pH 8.0,高压灭菌。

(2)1M Tris×Cl:121.14g Tris碱溶于800ml双蒸水中,用盐酸

调pH值至8.0,定容至1000ml,高压灭菌。

(3)0.5M EDTA:186.1g EDTA溶于800ml双蒸水中,用NaOH调pH值至8.0,定容至1000ml,高压灭菌。

(4)10% SDS:SDS 100g溶于900ml双蒸水中,加热至68℃助溶,用盐酸调pH值至7.2,定容至1000ml。

(5)1×SET缓冲液:0.01M Tris×Cl,0.005M EDTA,0.5% SDS,高压灭菌。

(6)10×TBE缓冲液:将54g Tris碱,27.5g硼酸和20ml 0.5mol/L EDTA(pH 8.0)加到800ml双蒸水中,定容至1L。

(7)蛋白酶K贮液(10mg/ml):将100mg蛋白酶K溶解于10ml灭菌蒸馏水中,分装后贮存于-20℃。

(8)饱和酚溶液:在68℃水浴锅中溶解结晶酚,160℃蒸馏,加入8-羟基喹啉至终浓度0.1%,加入等体积0.5M Tris×Cl(pH 8.0),摇动混合20min,分液漏斗中静置,分层后留下层黄色酚液,加入等体积0.1M Tris×Cl(pH 8.0),0.2%b-巯基乙醇(每800ml酚液中加入200ml)。

(9)EB贮存液(10mg/ml):在10ml双蒸水中溶解100mg EB。

(10)Ⅲ型6×凝胶加样缓冲液:0.25%溴酚蓝,0.25%二甲苯青 FF,30%甘油水溶液,4℃保存

血液基因组DNA的提取

1.取样本静脉血1ml,放入装有1ml抗凝剂(0.5mol/LEDTA)EP管中。

2.6000r/min离心15min,取白细胞层与另一10ml离心管中。

3.加两倍体积双蒸水,轻轻摇匀,静止15min,以破碎残余红细胞。

4.6000r/min离心15min,弃上层红细胞,留白细胞沉淀。加入1×SET缓冲液1ml,悬浮白细胞。在加入10mg/ml蛋白酶K 40ul、10% SDS100 ul(用枪吹打,使沉淀充分悬浮)。55℃水浴消化过夜。

注:a:此后步骤皆用剪平枪头的1ml枪头操作;

b:每步换管后标记以防样品混淆

c:酚具有腐蚀性,必须带手套操作。

5.将消化液一分为二,将其转入两个1.5 mlEp管中。加入等体积的饱和平衡酚,轻轻摇匀10min,12000r/min离心15min,吸取上层水相于另一离心管中。

6.用剪平的枪头吸出上层水相于另一离心管中,弃来去下层苯酚(如上层水相混浊可重复操作一次)

7.加入等体积酚/氯仿/异戊醇(25:24:1),轻轻摇匀10min,12000r/min离心15min,吸取上层水相于另一离心管中。

8.加入等体积氯仿/异戊醇(24:1),操作同上。

9.加入两倍体积预冷(-20℃)的无水乙醇,轻轻摇动离心管即有白色絮状DNA析出。记录DNA的量。

10.12000r/min离心5min使DNA沉淀于管底部,弃去乙醇。

11.待DNA干燥后,加入50ul TE/管,溶解DNA,置-20℃保存。

1.2.2 基因组DNA的浓度测定和质量检测

(1)测定DNA浓度:吸取2ul DNA样品,加双蒸水100ul,转入石英比色杯中,在蛋白核酸浓度测定仪中测定其浓度,并根据OD260/OD280比值分析DNA样品的纯度。

(2)检测DNA的质量:制备0.8%琼脂糖凝胶,内含0.5ug/ml溴化乙锭,倒入模具中待其自然凝固后,在电泳槽中倒入0.5×TBE电泳缓冲液。在DNA样品中加入1/6的Ⅲ型上样缓冲液,混合均匀后上样,同时在旁边的加样孔内加入1.5ul DNA Ladder Marker 100bp作为对照。以5V/cm电压(50V)电泳,当指示剂移至凝胶3/4时停止电泳,取出凝胶,紫外灯下观察并照相。

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