【实验目的】
掌握从琼脂糖凝胶中回收纯化目的DNA 片段的方法。
【实验原理】
在NaI 存在的条件下,融化含有DNA 片段的凝胶块,使DNA 片段吸附于硅胶树脂上,最后用TE 缓冲液溶出DNA。
【实验仪器】
1.台式高速离心机
2.水浴锅
3.电泳仪及水平电泳槽
【试剂及配制】
1. PCR Fragment Recovery Kit(硅胶树脂、NaI 溶液、浓缩缓冲液(使用时与100%乙醇等体积混合,此混合液称为洗净用缓冲液))
2. TE 缓冲液
【实验步骤】
1. 琼脂糖凝胶电泳制作1%琼脂糖凝胶,对目的DNA 进行琼脂糖凝胶电泳。
2. 切胶
在紫外灯下切出含有目的DNA 片段的琼脂糖凝胶。
3. 将切下的含有DNA 条带的胶块,置于1.5 ml Eppendorf 管中。
4. 加入600μl NaI 溶液,55℃温浴10 min。
5. 加入20 μl 硅胶树脂,混匀后室温静置20 min。
6. 10000 rpm 离心1 min,弃上清。
7. 加入500 μl 洗净用缓冲液,振荡混匀后10000 rpm 离心1 min,弃掉上清。此过程重复一次。
8. 加入30 μl TE 缓冲液,55℃温浴5 min。
9. 10000 rpm 离心1 min,回收上清-20℃保存备用。
【注意事项】
1. 切胶时不要将DNA 长时间暴露于紫外灯下,以防止DNA 损伤;同时应防止外源DNA 的污染。
2. 尽量除去不含目的DNA 的多余胶块,可以提高回收效率。
3. 硅胶树脂使用前要混匀。
4. 在步骤6 中,先保留上清,待回收过程结束后若经过检测回收效率高后可把上清弃掉,否则应保留上清,并再次加入硅胶树脂重新回收。
5. 长链DNA 的回收效率较高,短链DNA(500bp 以下)的回收效率稍有降低。
6. 洗脱DNA 时,TE 缓冲液或超纯水的用量视用户对浓度的要求而定。