阳性单菌落扩增与小量DNA制备

2010-03-28 19:44 · Alston

目 的 1.为进一步鉴定重组质粒提供适量的质粒DNA。 排除自身环化。鉴定方法主要有: (1)PCR法及其利弊。采用载体两端的引物进行PCR,一旦插入成功,则可以在电泳的凝胶中见到与插入片段分子量大小一致的PCR产物。 (2)Southern blot法及其利弊。将培

目 的

1.为进一步鉴定重组质粒提供适量的质粒DNA。

排除自身环化。鉴定方法主要有:

(1)PCR法及其利弊。采用载体两端的引物进行PCR,一旦插入成功,则可以在电泳的凝胶中见到与插入片段分子量大小一致的PCR产物。

(2)Southern blot法及其利弊。将培养皿上的菌落转移到硝酸纤维素膜上,变性、固定,以插入片段为探针作Southern blot。重组成功者,在相应的菌落位置上可以见到放射自显影的黑点,培养皿上对应的菌落即为重组成功者。

(3)酶切鉴定法及其利弊。

2.提供一定数量的DNA以满足一些实验,比如1)测序、2)准备杂交用的探针。这便是本实验的两个主要目的。

有关微型真空柱和离心柱的利弊。原理与本实验近似,区别在于DNA的回收不是采用酒精沉淀,而痕量乙醇,这将妨碍一些对乙醇敏感的酶的活性,使后续的工作困难。

原 理

挑选单一菌落,培养扩增。离心收集扩增了的大肠杆菌,用碱性液裂解细菌,再经酸性溶液形成钾-SDS-蛋白质-膜复合物,离心后,此复合物与细菌染色体DNA、高分子量的RNA得到沉淀,而细菌中小分子量的质粒DNA溶于上清之中。上清经乙醇沉淀后,得到质粒DNA。

实验准备

一.器材

Falcon 2070管

台式Eppendorf管离心机

可调移液器P1000、P200、P20及其经消毒的盒装蓝、黄吸头

经消毒的1.5ml Eppendorf管、试管架及其水浴用试管架

定时器、记号笔、一次性手套和筒纸

4℃和-20℃冰箱

煤气灯或酒精灯

恒温培养摇床(调至37℃,240rpm)

台式4℃ Eppendorf管离心机

离心真空干燥器

37℃水浴

二.试剂

含抗生素的LB培养液

TE(10mM Tris,1mM EDTA,pH 8.0)

100%预冷乙醇

75%预冷乙醇

目 的

1.为进一步鉴定重组质粒提供适量的质粒DNA。

排除自身环化。鉴定方法主要有:

(1)PCR法及其利弊。采用载体两端的引物进行PCR,一旦插入成功,则可以在电泳的凝胶中见到与插入片段分子量大小一致的PCR产物。

(2)Southern blot法及其利弊。将培养皿上的菌落转移到硝酸纤维素膜上,变性、固定,以插入片段为探针作Southern blot。重组成功者,在相应的菌落位置上可以见到放射自显影的黑点,培养皿上对应的菌落即为重组成功者。

(3)酶切鉴定法及其利弊。

2.提供一定数量的DNA以满足一些实验,比如1)测序、2)准备杂交用的探针。这便是本实验的两个主要目的。

有关微型真空柱和离心柱的利弊。原理与本实验近似,区别在于DNA的回收不是采用酒精沉淀,而痕量乙醇,这将妨碍一些对乙醇敏感的酶的活性,使后续的工作困难。

原 理

挑选单一菌落,培养扩增。离心收集扩增了的大肠杆菌,用碱性液裂解细菌,再经酸性溶液形成钾-SDS-蛋白质-膜复合物,离心后,此复合物与细菌染色体DNA、高分子量的RNA得到沉淀,而细菌中小分子量的质粒DNA溶于上清之中。上清经乙醇沉淀后,得到质粒DNA。

实验准备

一.器材

Falcon 2070管

台式Eppendorf管离心机

可调移液器P1000、P200、P20及其经消毒的盒装蓝、黄吸头

经消毒的1.5ml Eppendorf管、试管架及其水浴用试管架

定时器、记号笔、一次性手套和筒纸

4℃和-20℃冰箱

煤气灯或酒精灯

恒温培养摇床(调至37℃,240rpm)

台式4℃ Eppendorf管离心机

离心真空干燥器

37℃水浴

二.试剂

含抗生素的LB培养液

TE(10mM Tris,1mM EDTA,pH 8.0)

100%预冷乙醇

75%预冷乙醇

RNase (10mg/ml)

3M NaAC

溶液I

50 mM 葡萄糖

25 mM Tris.Cl (pH 8.0)

10 mM EDTA (pH 8.0)

在10 lbf/in2(6.895*104pa)高压灭菌15分钟,贮存于4℃。

溶液II

0.2 N NaOH

1% SDS

溶液III

5 M 乙酸钾 300 ml

冰乙酸 58 ml

水 142 ml

存于4℃。

消毒过的双蒸水

三.实验材料

含阳性菌落的培养皿

碎冰及碎冰保温盛器

实验步骤

1.第一天(通常为下午)

从琼脂平板上挑取单一菌落,接种到Falcon管内的5ml LB培养液(含氨卞青霉素)中。放入37℃恒温摇床,225-250 rpm剧烈摇晃培养过夜(O/N)。

2.第二天(通常上午开始)

(1)吸取1.5ml培养液,移入Eppendorf管中,台式离心机室温下1.4万转离心2分钟,弃上清,重复一次,以取得较大的沉淀。剩余培养液存入4℃冰箱。

(2)弃上清,加入100ul溶液I,盖上盖,剧烈震荡(可以将管底抵于试管架面上,划15下),充分浮悬细胞沉淀,置-20℃冰箱内5分钟。

(3)自冰箱中取出试管,加入200ul溶液II,轻轻颠倒混匀,放于冰上5分钟。

(4)加入150ul溶液III,轻轻颠倒混匀,放于冰上15分钟。

(5)放入台式离心机,室温下1.4万转离心3分钟,将上清移入一新的Eppendorf管,加入1ml 100%乙醇,混匀,放入-20℃冰箱5分钟。

(6)自冰箱中取出试管,迅速移入4℃环境下的台式离心机,1.4万转离心5分钟,小心弃去上清,倒置试管于纸巾上流尽乙醇。

(7)加入300ul TE和2ul RNase,重浮悬沉淀,放试管于37℃的水浴中温育30分钟。

(8)加入3M NaAC 34ul,混匀,加入1ml预冷的100%乙醇,-20℃存放5分钟。

(9)自冰箱中取出试管,迅速移入4℃环境下的台式离心机,1.4万转离心5分钟,弃去上清。

(10)加入1ml预冷的75%乙醇,迅速移入4℃环境下的台式离心机,1.4万转离心10分钟,弃去上清。

(11)旋转真空干燥10分钟。于冰上,溶解沉淀于20ul水中。

实验结果

通常可获得3~5ugDNA。

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