一、原理
l噬菌体DNA作为一种基因工程载体,在组建动植物基因组DNA和cDNA文库方面具有重要用途。lDNA通常被包在一个蛋白质外壳中。蛋白质外壳经链霉蛋白酶(或蛋白酶K)和SDS处理后,发生解体和变性,最后可通过苯酚抽提和离心被去除。保留在水相中的DNA可经乙醇或异戊醇沉淀后离心收集。
二、目的
进一步了解l噬菌体的特性,掌握l噬菌体DNA的提取原理和分析方法。
三、试剂与用品
1、l噬菌体原液。
2、受体菌。
3、LB液体培养基(5ml/管,100ml/瓶)。
4、LB固体平板培养基。
5、1M MgSO4。
6、20%PEG 8000/2M NaCl。
7、SM溶液。
8、DNase(10mg/ml)。
9、RNase(10mg/ml)。
10、0.5M EDTA(pH 8.0)。
11、Proteinase K(10mg/ml)。
12、10%SDS。
13、3M醋酸钾。
14、TE缓冲液。
四、操作步骤
1、接种一个噬菌体敏感菌单菌落于5ml含0.2%麦芽糖和10mM硫酸镁的LB培养液中,振荡培养5-6小时,至OD值为1.0-1.5。
2、预热50ml LB培养液至37℃。
3、取一干净无菌带盖的玻璃试管,加入0.1ml受体菌和0.05ml噬菌体贮备液,37℃振荡培养30分钟。
4、将上述感染物转入预热的50ml LB培养液中,再补加500ul 1M硫酸镁,并于摇床上培养过夜。
5、次日,加3ml氯仿,37℃振荡培养15分钟,使细菌裂解。
6、将培养物转入50ml无菌带盖的离心管中,8000rpm,离心20分钟。
7、将上清液分装到3个50ml 无菌带盖的离心管中(每管15ml)。每管加入15ml预冷的PEG/NaCl(一倍体积)混合后,在冰浴上放置60分钟。
8、4℃,9100rpm离心20分钟。
9、弃去上清液,在吸水纸上倒置数分钟。
10、用500ul SM液悬浮噬菌体,转入1.5ml 的Eppendorf管中。
11、加1ul DNase和4ul RNase,混合,37℃温育20分钟。
12、加50ul EDTA,混合后65℃水浴5分钟。
13、加2ul Proteinase K和25ul 10%SDS,混合后65℃水浴15分钟。
14、加入100ul 3M醋酸钾,冰浴上静置20分钟。
15、1200rpm离心15分钟,分相。
16、转上清液到新的Eppendorf管中,加600ul异丙醇, 轻轻颠倒2-3次,冰浴10分钟。
17、离心,13000rpm,10分钟。
18、弃上清液,加1ml 70%乙醇,冲洗,不必悬浮起来。
19、13000rpm离心10分钟,弃上清液。
20、空气干燥。
21、加50ul TE Buffer悬浮,4℃保存待用。
22、进行琼脂糖凝胶电泳,检测制备的样品(参见实验https://shiyan.ebioe.com/DNAagarosegel-electrophoresis.htm)。