拟南芥基因组DNA的分离提取

2010-04-06 16:56 · Duke

【实验目的】 F 掌握拟南芥基因组DNA的抽提原理和方法。 【实验原理】 通常采用机械研磨的方法破碎拟南芥的组织和细胞,由于拟南芥细胞匀浆含有多种酶类(尤其是氧化酶类)对DNA的抽提产生不利的影响,在抽提缓冲液中需加入抗氧化剂或强还原剂(如巯基乙醇)以降低这些酶类的活性。在

【实验目的】

F 掌握拟南芥基因组DNA的抽提原理和方法。

【实验原理】

通常采用机械研磨的方法破碎拟南芥的组织和细胞,由于拟南芥细胞匀浆含有多种酶类(尤其是氧化酶类)对DNA的抽提产生不利的影响,在抽提缓冲液中需加入抗氧化剂或强还原剂(如巯基乙醇)以降低这些酶类的活性。在液氮中研磨,材料易于破碎,并减少研磨过程中各种酶类的作用。

十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate,简称SDS)是离子型表面活性剂,能溶解细胞膜和核膜蛋白,使核蛋白解聚,从而使DNA得以游离出来。再加入苯酚和氯仿等有机溶剂,能使蛋白质变性,并使抽提液分相,因核酸(DNA、RNA)水溶性很强,经离心后即可从抽提液中除去细胞碎片和大部分蛋白质。上清液中加入异戊醇使DNA沉淀,即得拟南芥总DNA。

【实验器材】

F 试剂耗材:提取液(0.2M Tris-HCl(pH7.5)、0.5%SDS、0.25M NaCl、1%β-巯基乙醇)、异丙醇、氯仿、异戊醇、RNAase A、研钵、液氮、1.5ml离心管。

F 仪器:恒温水浴锅、离心机。

【方法步骤】

(1) 取新鲜的拟南芥叶片2~3片加入1.5ml的离心管中,加入液氮,玻璃棒研碎。

(2) 研磨以后,加入600~700µl的提取液,混匀,然后在60℃下水浴20~60分钟。

(3) 4℃,12000rpm/min离心10分钟。

(4) 把上清转至新的离心管中,加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),4℃,12000rpm/min离心7分钟。

(5) 把上清转至新的离心管中,加入70%体积的异丙醇,混匀,4℃,12000rpm/min离心15分钟。

(6) 弃上清,70%乙醇洗涤沉淀2次,吹干。

(7) 沉淀用20~30µl含有0.1mg/ml RNAase A的ddH2O 溶解。

(8) 用0.8%的琼脂糖凝胶检测提取的拟南芥总DNA。

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