SSR（simple sequence repeat ）技术是另一种非常有用的分子标记技术，在生物体基因组内存在许多重复的简单序列小片断，在不同种内小片断的重复数不同，这种不同的重复数，是由其遗传基因所决定，有种属特异性，这种差异经PCR扩增后，被放大到可检测程度。因此SSR构成了另一种标记系统。
一：仪器：PCR仪电泳仪
二：试剂：SSR试剂盒电泳试剂
三：操作1：总DNA提取操作同实验一
2：PCR扩增模板DNA50ng第一轮扩增参数第二轮扩增参数
10×PCR缓冲液1.5ul95℃1min 95℃1min
25mM氯化镁1.5ul 65℃1min 55℃1min
10mMdNTP 0.5ul 72℃1min 72℃ 1min
SSR上下游引物各50ng第一轮13cycle,复性温度从第三循
5u/ulTaq酶0.15ul 环开始每一循环降低1℃直到55℃,
加水至15ul 第二轮30 cycle
3:电泳检测测序胶电泳，EB或龈染操作同前面实验。
附录
1：核酸浓度的测定
1.1分光光度计法
将核酸样品溶于TE缓冲液中测定和OD280，根据经验数据判定DNA浓度，一般OD260＝1时，双链DNA样品的浓度为50ug/ml。
1.2电泳法
将已知浓度的标准DNA样品成梯度稀释，将此成浓度梯度的标准样品与未知样品在同一块胶上电泳，显色后，找出与未知样品亮度相当的已知样品带，此已知样品的浓度即相当与未知样品的浓度。
