基因组测序技术迈入第三代 测序成本将助推个体化医疗

2011-11-30 13:00 · pobee

Nature杂志就接连发表了三项重要的基因组测序成果:帝王蝶基因组、叶螨基因组、猪蛔虫基因组。其中来自麻省大学医学院的研究人员公布的帝王蝶基因组序列是首个被破译的蝴蝶基因组。

导读:随着测序技术的发展,近年来生物基因组一个接着一个的被破译,本周(11月24日)顶级杂志Cell,Nature杂志就接连发表了三项重要的基因组测序成果:帝王蝶基因组、叶螨基因组、猪蛔虫基因组。其中来自麻省大学医学院的研究人员公布的帝王蝶基因组序列是首个被破译的蝴蝶基因组,也是首个长途迁移标志性基因组成果。因此被Cell杂志作为封面文章进行推荐。

帝王蝶基因组被测出

基因组

基因组(Genome)是指单倍体细胞中全套染色体或全部基因。

基因组测序

基因组测序(Genome Sequencing)是指对某个物种基因组核酸进行测序,最终要确定该物种全基因组核酸的序列图。

个体基因组测序即将来临

由ILLUMINA公司出品的高级测序仪器使得西澳大学的研究者们在一天之内可以捕捉到几乎整个人类的基因组,且只需花费数千美元,而这一结果在此前花费了人类基因组计划研究组40亿美元,耗时10年才完成。

DNA测序后归类在不同的基因图谱中,通过观察比较,研究者可鉴别出哪些基因关联到特定的疾病。

基因组测序诊断癌变风险

“神秘”的DNA测序已从研究领域进入医学应用领域,以基因测序为基础的个性化治疗,将对癌变的基因对症下药。届时,癌症患者将告别手术和化疗的治疗方式,只需服用相应药物,就可以修复癌变基因。

基因组测序实现个性化治疗。癌症患者到医院就诊时,可通过基因测序,锁定患者体内哪些基因发生突变,从而让医生根据个人不同的基因组特征和生活环境因素“量身用药”。

乔布斯胰癌测序

乔布斯曾经花费10万美元将他的癌肿瘤和正常的DNA进行测序。目前全世界只有20个人进行了DNA测序。

乔布斯的DNA测序是由斯坦福大学、John Hopkins、哈佛大学和麻省理工学院的团队进行的。在这种昂贵的基因测序过程中,医生可以得到癌症肿瘤的详细情况,并可以针对该情况制作特定的药物。

第三代测序仪由德国总理默克尔启动

2011年9月13日,德国总理默克尔在访问柏林Max Delbruck分子医学中心时,启动了该中心新安装的一台单分子实时DNA测序系统——PacBio RS。

PacBio RS是一台革命性的第三代DNA测序系统,它融合了新颖的单分子测序技术和高级的分析技术来实时揭秘生物学。此系统具有较大的序列读长(平均达1000个DNA碱基),在不到一天的时间内获取数据,以及测序前无需扩增DNA同时避免潜在的错误。

千亿基因测序产业启动

“十二五”期间,我国的生物产业要完成10000种微生物、100种动植物组基因测序、发现约500个新的功能基因。

按每种微生物进行“基因组完成图”测序的费用为30万—50万的价格来看,微生物的基因测序带来的市场规模将达到的规模超乎市场之前的预料。而全球著名财经杂志《福布斯》曾刊文指出,在中国,基因测序技术将构成一个千亿元规模的市场。

Complete Genomics 公司引领测序行业

Complete Genomics公司的生产能力大约是每月600个基因组,据估计,到年底会提高到800-1200个基因组。每台测序仪每天可产生1-2个基因组,预计到2012年上半年会提高至6个基因组。

据Bansal估计,从去年7月到今年8月3日,Complete Genomics已经完成了7000个人类全基因组的测序,而Illumina基因组网络估计只有3250个。华大基因也提供人类全基因组服务,但Bansal未提供估计数字。

Life Technologies 公司开发出Ion Torrent测序平台

今年初,Life Technologies的董事长就曾表示,Ion Torrent已利用其PGM完成对摩尔的基因组的测序,令摩尔成为第一个用“post-light”测序技术测序的人。此外,还对三种细菌(费氏弧菌、 大肠杆菌和沼泽红假单胞菌)的基因组进行了测序。

与一般的测序平台不同,Ion Torrent测序平台的核心是一块创新的半导体芯片,其中包含了数百万个孔和感应器。这块离子芯片所使用的电子检测系统简化了测序过程,并大大降低了测序仪的费用。

 

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