基因组生物信息学分析的系统新算法研究及其应用

2011-10-24 10:49 · zhangchunting

该项目利用基因识别算法;G+C含量的无窗口计算算法;RY,MK,GC和AT差异曲线算法以及基因组段落化算法对大量的基因组序列进行了分析。研发了基于新基因识别算法的适用于一切细菌和古细菌基因组的ab initio蛋白质编码基因的识别软件ZCURVE 1.0;适用于冠状病毒基因识别软

该项目利用基因识别算法;G+C含量的无窗口计算算法;RY,MK,GC和AT差异曲线算法以及基因组段落化算法对大量的基因组序列进行了分析。研发了基于新基因识别算法的适用于一切细菌和古细菌基因组的ab initio蛋白质编码基因的识别软件ZCURVE 1.0;适用于冠状病毒基因识别软件ZCURVE_CoV;适用于一切病毒和噬菌体基因组的基因识别软件ZCVRVE_V。制定出人类基因组在DNA序列水平上的第一张Isochore结构图谱;成功地识别出一些重要的基因组岛。在国际上首先预测出硫磺矿硫化叶菌(Solfolobus solfataricus)基因组具有3个复制起始位点,并预测出它们的准确位置,为以后的实验所证实。

原文地址:https://dbpub.cnki.net/Grid2008/Dbpub/detail.aspx?filename=SNAD000001200128&dbname=SNAD&uid=

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