Illumina公司最受期待的台式下一代测序(NGS)仪器MiSeq投入全面生产。该仪器在流线型样品处理、支持该仪器的新的云平台BaseSpace等方面进行了一系列强化。
“我们正在改变人们的需求，”Illumina公司负责市场的副总Jordan Stockton说道，他是计算生物学方面的专家。
Stockton说，新的BaseSpace云平台的目标是“提供准确无误的数据获取方式，扩展空间并提供各种不同类型的分析工具。我们对该云平台感到很兴奋，它是一个整合的工作流程，一站式解决存储及协作问题。”
Illumina的CEO Jay Flatley评论说：“加入BaseSpace降低了对昂贵的IT基础设施的需求，简化了对具任何规模及经验的实验室个人测序仪的接入程序。”
“我们想推动大家使用云，是因为我们觉得它是一个更为简单、便宜的解决方案，并提供了高水平的协作。你可以在任何你需要的地方使用测后DNA的库及质量并进行转移。”Stockton说。
该云平台应用了Amazon EC2。“它们确实有助于我们部署工作，”Stockton说。将来，BaseSpace还将与HiSeq 2000兼容，成为库级别数据的通用目标工具，但是目前只能用于MiSeq。
Illumina说，启动后它将为客户及非客户提供BaseSpace访问，允许他们测试公开共享的数据。“谁都可以去访问并查看数据，” Stockton说。
在2011年第三季度，Illumina产出了大约45台MiSeq设备，现在正进行全面生产，库存良好。MiSeq零售价125000美元，被寄予希望能在台式NGS市场与Ion Torrent Personal Genome Machine（简称PGM）形成良性竞争。
华盛顿大学基因组研究院的副院长Elaine Mardis对此赞赏有加。“在我们过去20年测试过的仪器中，MiSeq是目前最好的即插即用型机器。” Mardis说，“一个星期内，我们就完成了从拆箱到安装并进行了四次高数据质量的运行。质量高、运转只需一天，这将促进我们的应用程序的发展并使下一代测序向临床更进一步。”
Stockton说，与大约一年前相比，Illumina建立了引人注目的流线型NGS工作流程。在以前，进行目标基因测序的研究人员必须准备扩增产物、试剂、进行模拟、订购（或合成）探针、DNA富集或纯化、构建文库、多重扩增，然后才能进行测序并再去多重化。
“我们对此进行了精简，” Stockton说。“现在你可以在线设计探针……并插入富集过的样品。加载好样盒后按下MiSeq上的启动键，数据实时进入库中，并传送至云端进行存档。”
“这就改变了进行目标测序的样式和感觉”，他说。
MiSeq每27小时可运行2x150碱基对，总通量为1.7GB。
多个因素实现了这种更长的序列阅读：缩短化学反应时间、孵育时间以及扫描。微生物测序将是一个有利可图的市场，对基因组DNA进行一次改良的90分钟样品准备后，整个运转时间缩减到一天以内。“一个晚上就能从样品得到结果。” Stockton说。（生物探索 william）
