前段时间，高兄写了一篇《物以类聚vs同类相斥》，本来想写点什么，一直拖到现在。同类之间，除了竞争，也会有协作。像是非洲鬣狗，为了捕杀一头大角马，也会互相协作配合。总之，概括起来，应该是“生于忧患，死于安乐！”这也是利益博弈的精髓。在忧患中寻找平衡，在安乐中失去平衡。
初中时，在电影院里看过《狮子王》，狮子父亲对小辛巴说：生命世界的万事万物都在平衡中生存，身为国王，你不但要了解那种平衡，还要尊重所有的生物，包括爬行的蚂蚁和跳跃的羚羊。电影里，精诚团结的非洲鬣狗成了反面角色，他们毫无节度的索取，最终破坏了平衡，引起了内杠。为了在利益的博弈中拔得头筹，生命们会无所不用其极！
不过为了对抗恶劣的环境，同类的生命也会携手相扶读过难过。之前看过一篇Nature的文章，作者发现，面临抗生素胁迫时，耐药菌会释放一种信号——吲哚，帮助其他菌读过难关。当初看到这篇文章觉得很惊讶，不过细想来也是。营养丰富，大家都要争着吃饱吃好。一旦大祸临头，可不要相互扶持。从菌落世界到人类社会也都这样。
不只是在同类的个体之间，对于一个复杂生命体内部的网络平衡也是如此。各条pathway之间既相互竞争也会相互代偿合作。记得钟老师组的一篇PNAS，用系统生物学的方法模拟植物的光合作用。他们发现，在缺水胁迫时，各条pathway之间的协作会增加。不过缺水到一定限度，系统就崩溃了。
动物界也有类似的现象——就是热量限制，也就是限食。限食可以长寿，可以防癌。不过也可以理解为，限食状态时，各系统之间的协作增强了，危机环境反而避免生命的损耗，也避免癌细胞的坐大！
从动物整体回到细胞，想想那个有趣的菌落实验。体外培养的细胞之间也会有交流吗？应该是会有的！那么关于细胞凋亡，可能需要重新考虑。 对于一个引起细胞凋亡的胁迫因素，为什么有的细胞先死，有的后死？我曾问过我身边的朋友，他们多回答，那是因为细胞状态不同。好吧，姑且我也这么认为，那么先死者对后死者有没有什么影响？先死的细胞会释放什么东西吗？类似细菌释放的吲哚？
我们现在对细胞凋亡的研究多是从群体上考虑，这一组凋亡了多少，那一组有没有减少，等等。能不能深入细胞群体内部了解下他们之间的关系。细胞群体里也会有“英雄好汉”吗？ 这是现在比较热门的单细胞研究。哈佛的谢晓亮组做了出色的工作。去年他们在Science上发了一篇文章，其中一个发现是：单细胞中某基因在某一时刻的mRNA表达拷贝数与其蛋白表达拷贝数无关，由此可见，单个细胞中的蛋白组分析与转录物分析是没有关联的。
当时他们的解释是：这种关联性缺失的一个原因是mRNA分子和蛋白质分子在细胞内的寿命长短不同。mRNA只存在几分钟，而蛋白质分子可以存在数个小时，大大超过细胞周期。此外，对很多细胞而言，一些蛋白的唯一来源来自于母细胞，而mRNA只是偶尔产生。这就导致了在细胞分裂过程中某些蛋白质分子分配不均衡，这种现象在哺乳动物细胞中同样存在。
对于哺乳动物的细胞，应该也是这样的，不过解释未必一定是噪音所致。我们给予一个诱导物时，未必一定要所有细胞都上调某个基因，因为我们现在的实验方案多是测量一群细胞的表现，而对于细胞群体之间应该是会有相互的交流。比如，当一个细胞高表达一个mRNA时，它会不会发出信号告诉临近的细胞要少表达点？ 从资源的获取上，这种情况在物资匮乏时，更是这样。试想想，一个细胞加足马力生产蛋白时，必然会大量消耗附近的资源，比邻的细胞势必就会处于被动竞争的状态。
总之，生命很神奇，但生存总归是第一要务。 “生于忧患，死于安乐！”
后记：
我们现在不清楚细胞间究竟是用什么传递信号的。不过课题外做了个小实验，把培养了3h的细胞上清，换到一份新的细胞中，同时给予过氧化氢刺激，与新鲜的培养基对照比，培养了3h的细胞上清明显有很好的保护作用，而且如果事先给予低浓度的过氧化氢胁迫，保护作用更好。
这说明细胞一定是释放了什么？既然是氧化胁迫，会不会是细胞释放了SOD（分泌型的超氧化物歧化酶）。如果是这样，推而广之，在一群细胞里，势必会有分泌多的和分泌少的，会在各自周围形成一种保护圈（浓度梯度），试想想——在一个强分泌型的细胞周围，必然会顺便得到更大的保护。如果一个细胞崩解了（凋亡或死亡），会不会把内部的抗氧化剂泄漏出来？应该是有可能的。
另外一个现象似乎可以从侧面说明这个问题。对于同等浓度的氧化胁迫，细胞的接种密度越高越耐受，越稀疏，越不耐受。
当然，不仅仅是抗氧化，其他胁迫情况，也会对应其他的保护机制，我想。
