如何拼接12Sr rRNA、16S rRNA序列进行系统发育树构建
熊荣川
分子系统学经常使用12Sr rRNA、16S rRNA进行物种系统发育树的构建，分别使用任何一个，信息量都显得较小。因此，在两序列的具有的情况下，最好将两序列拼接然后进行系统发育树构建。
通常，12Sr rRNA、16S rRNA在线粒体上位置较为接近，但却并非首尾相连，中间隔着一些转运RNA基因，加之基因重排因素，导致这些间断序列有较大的差异，尤其是在大尺度的系统发育分析案例中。因此较为科学的方法是，对12Sr rRNA、16S rRNA分别比对，将比对后的序列进行拼接。拼接方法如下（前提条件是两组序列的物种组成一致）
将12S、16S序列分别导入BioEdit（ ），使用同样的方法进行序列排序（序列->分类->按标题），保存序列。
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