NTsys实现聚类分析及树状图的绘制

2011-04-02 02:58 · zjlcas

NTsys可以处理质量性状与连续数量性状,并据此计算多种距离矩阵,根据距离矩阵采取适当的聚类方法得到聚类图。 每一个运算步骤,均有相应的模块执行,需要做的只是选择相应的参数。

 

注意:聚类分析和树状图在R软件中能够十分方便的实现,而在NTsys中实现的过程较为复杂。但由于NTsys软件是图形界面操作的,这里仍然列出相应的操作步骤,以供同仁参考。
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NTsys可以处理质量性状与连续数量性状,并据此计算多种距离矩阵,根据距离矩阵采取适当的聚类方法得到聚类图。 
每一个运算步骤,均有相应的模块执行,需要做的只是选择相应的参数。 
以UPGMA法为例 
对于数量性状,常遵循以下步骤: 
 
 
1 矩阵的制作 
 
操作:在Excel里,按照NTsys的要求面做好矩阵。 
 
第1行第1个数字一般填1,代表要处理的数据为数字矩阵。 
第1行第2个数字填行数,第3个数字填列数。 
第1行第4个数字,如果有缺失值填1,没有缺失值填0.当然最好不要有缺失值。 
 
第2行 按照顺序填写每一列的名称。第2行的定格要空出来。 
第3行 开始才是正式的数据矩阵。从第3行开始,第1列作为要操作的单元名称。 
数据准备好后,一般要存为Excel97格式。 
 
再用ntedit打开,查看是否有错误,如果没有错误,建议另存为“.nts”格式的文件,如data.nts. 
 
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