希望南科大不要成为“南柯大”

2011-06-27 15:37 · zhangnju

本人所在的南京大学生物物理研究所于2006年新增基因网络动力学研究方向。我们试图将细胞信号转导与基因表达调控联系起来,通过构建具有生物学意义的系统模型,运用数值模拟和理论分析的方法,究细胞信号转导网络的结构、 动力学和功能及其联系。

 本人所在的南京大学生物物理研究所于2006年新增基因网络动力学研究方向。我们试图将细胞信号转导与基因表达调控联系起来,通过构建具有生物学意义的系统模型,运用数值模拟和理论分析的方法,究细胞信号转导网络的结构、 动力学和功能及其联系。 目前,我们主要研究真核生物基因表达的调控动力学、p53信号通路所介导的细胞对DNA损伤的响应过程、 细胞命运的抉择机制(涉及细胞增殖、衰老、凋亡等)、由正负反馈回路组成的基序等在信号处理过程中的功能及其生物物理机制等。经过五年的努力,虽然在该领域取得了一些进展,但离本领域优秀的实验室还有很大差距。特别是理论和实验结合方面亟需加强,希望能和国内外同行增进交流,加强合作。以下是本实验室近五年来在该领域发表的一些论文,欢迎大家多提宝贵意见。 

1.   Xiao-Peng Zhang, Zhang Cheng, Feng Liu, and Wei Wang,

Cell fate decision mediated by p53 pulses,

Proc. Natl. Acad. Sci. USA,106, 12245 (2009).

2.   Xiao-Peng Zhang, Feng Liu and Wei Wang,

 Two-phase dynamics of p53 in the DNA damage response,

Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 108,8990 (2011).

3.   Xiao-Peng Zhang, Feng Liu and Wei Wang

Coordination between cell cycle progression and cell fate decision by the p53 and E2F1 pathways 

in response to DNA damage, 

J. Biol. Chem., 285,31571(2010).

4.    Xiao-Peng Zhang, Zhang Cheng, Feng Liu, and Wei Wang,

Linking fast and slow positive feedback loops creates an optimal bistable switch in cell signaling, 

Phys. Rev. E, 76, 031924 (2007).

5.    Tian Pu, Xiao-Peng Zhang, Feng Liu and Wei Wang,

Coordination of the nuclear and cytoplasmic activities of p53 in response to DNA damage, 

Biophy. J., 99,1696 (2010).

6.  Xiao-Jun Tian,Xiao-Peng Zhang, Feng Liu, and Wei Wang,

Interlinking positive and negative feedback loops creates a tunable motif in gene regulatory networks, 

Phys. Rev. E, 80, 011926 (2009).

7.   Zhang Cheng, Feng Liu, Xiao-Peng Zhang, and Wei Wang,

 Reversible Phosphorylation Subserves Robust Circadian Rhythms by Creating a Switch in 

 Inactivating the  Positive Element, 

Biophys. J., 97, 2867 (2009).

8.   Zhang Cheng, Feng Liu, Xiao-Peng Zhang, and Wei Wang,

Robustness analysis of cellular memory in an autoactivating positive feedback system, 

FEBS Lett. 582, 3776 (2008).

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