一、下载cygwin：
1.到www.cygwin.com上下载cygwin.exe，此文件只有572kb；
2.下一步选择install from internet或者download without installing；
3.默认下一步，下载网站时选择https://mirrors.kernel.org这个；
4.select packages这一步关键，将devel, editor, graphies, shells, x11这几项的“default”点击为“install”；
5.一直下一步即可。
二、下载autodocksuite-4-Cygwin.tar.gz
网址：https://autodock.scripps.edu/downloads
解压到:cygwinusrlocalbin
三、下载安装python2.5
网址：https://python.org/download/
四、下载安装MGLTools1.5.2
网址：https://mgltools.scripps.edu/downloads/tars/releases/REL1.5.2/MGLTools-1.5.2-Setup.exe
五、下载MGLTools1.5.2补充压缩包
网址：https://mgltools.scripps.edu/downloads/tars/releases/REL1.5.2/MGLToolsPckgs.zip
解压到：Python25Libsite-packages
六、至此，安装完毕
从:Python25Libsite-packagesMGLToolsPckgsAutoDockToolsbin下的runadt.py运行，开始对接。
