2010西农大全日制工程硕士(生物工程领域, 生物信息工程方向)和兽医硕士考研调剂信息

2010-03-30 01:43 · delizhang

考虑到本校动物医学院今年没有应届毕业本科生,本人唯一在读的一名全日制兽医硕士系本校兽医本科应届毕业,且综合素质高,实际也在按学术型硕士生培养,有上博士生的潜力,对招收这样的兽医硕士我仍有兴趣,同时,前年也有很好的生物信息学专业学生调剂到我名下,作为研二硕博连读生其SCI论文将投出

考虑到本校动物医学院今年没有应届毕业本科生,本人唯一在读的一名全日制兽医硕士系本校兽医本科应届毕业,且综合素质高,实际也在按学术型硕士生培养,有上博士生的潜力,对招收这样的兽医硕士我仍有兴趣,同时,前年也有很好的生物信息学专业学生调剂到我名下,作为研二硕博连读生其SCI论文将投出,且协助建立了生物信息学平台,由于科研与工程的不同,需要招收全日制工程硕士专业学位研究生从事生物信息工程研发,特发布此消息。以西农大研究生院要求为准进行动物医学院兽医硕士或生命科学学院工程硕士(生物工程领域)专业学位研究生调剂。西农大研究生院将出台与兄弟院校同等优惠的全日制专业学位研究生招收政策。请通过国家英语4级或计算机等级考试的拟调剂优秀学生把附照简历发到电子邮箱ericmapes@126.com

我是把预防兽医学与生物信息学结合起来研究的,实际在研究病毒免疫与肿瘤病理,即研究方向为病毒感染免疫组学与肿瘤系统生物学,以人兽共患病毒病为主攻对象,以阐明疾病发生发展机理、筛选抗病育种基因谱和研发新型实用疫苗为远期目标,重点针对高致病性猪蓝耳病、猪流感、高致病性禽流感与甲型H1N1流感等异常天然免疫应答性呼吸道RNA病毒病生物“组学”、系统生物学机制研究并分子细胞生物学验证,核心问题涉及病毒感染的超高速路、非编码RNA与表观遗传信息网络和基于模式识别受体的抗病毒感染天然免疫信号转导、分子调控与病理损害机制等,如“重大病毒病病原宿主相互作用关键基因谱的系统生物学筛选、鉴定技术与实际应用”。

欢迎医药生命科学背景的学生调剂动物医学院全日制兽医硕士专业学位研究生,加盟西北农林科技大学动物医学院病毒免疫与生物信息研究室(Research Laboratory of Virology, Immunology & Bioinformatics, VIB),分子生物学、细胞生物学、现代遗传学与免疫学背景强者,“985工程”高校国家重点学科毕业者或“211工程”高校生源英语6级通过者优先考虑,研究方向为预防兽医。
执着钻研创新思维活跃或能言善辩综合素质高的自然科学背景学生均可调剂到生命科学学院全日制工程硕士(生物工程领域)专业学位研究生,特别欢迎对生物医学感兴趣的数理化、统计、信息和计算机等学科背景的学生调剂,加盟西北农林科技大学生物信息学研究中心分子病毒免疫与肿瘤系统生物学研究组(Investigation Group of Molecular Virology, Immunology, Oncology & Systems Biology),研究方向为生物信息工程,从事感染、免疫与肿瘤相关复杂性疾病系统生物学、miRNA组学、蛋白质组质谱数据的生物信息学处理、计算功能蛋白质组学、新基因(含非编码RNA)精确识别与功能预测、分子相互作用网络及进化分析,通过国家计算机四级考试的医药生命背景者优先考虑。

主要研究条件与氛围介绍:

本校预防兽医学专业是国家“985”工程和“211”工程重点建设学科,预防兽医学平台依托国家“985”工程二期“畜禽养殖与重大疫病防治”科技创新平台、国家“985”工程三期“动物医学生物技术和临床重要疾病防控”科技创新平台和农业分子生物学国家重点实验室培育基地(农业分子生物学陕西省重点实验室),建成目前西北高校独有的动物生物安全国家三级实验室(ABSL3),通过国家环境评估在认可委认可中。本校生物信息学研究中心去年末建成高性能计算平台,具有32个计算节点的IBM高性能刀片服务器机群,每个节点含2颗E5520CPU,24GB内存;网络架构使用DDR Infiniband高速交换模块。该32刀片IBM高性能计算机集群硬件价值200万元,另外购进配套软件价值135万元。

自2008年以来,在生物信息学方面,本人与本硕博均为西工大毕业的我校信息工程学院软件工程系主任张阳教授互为对方硕博生的第二导师,同时还有擅长开发来自西工大的李建良副教授协助指导,在本校软件工程研究中心双方研究生展开学科交叉合作。本人现有在读生物信息学研究生11名,其中生物科学背景博士生2名(今年秋季入学,其中1名将获得软件工程师资格证书),硕博连读研究生1名(通过国家计算机4级),信息与计算科学背景硕博连读研究生3名(本校免试推荐,其中2人今年秋季入学),计算机背景硕士生1名,生物工程与生物技术背景硕士生各2名,并在自己独立的2间机房一起工作,形成了良好的工作氛围。此外,本人有2倍于生物信息学专业的硕博生(预防兽医学与动物生物技术两个专业)可测定部分组学实验数据并进行必要实验验证。因此,生物信息工程硕士专业学位研究生培养质量有保障,相对于学术型硕士发表SCI论文影响因子不低于3.0的要求,工程硕士发表EI论文是很自然的事。

主要研究领域“重大病毒病病原宿主相互作用关键基因谱的系统生物学筛选、鉴定技术与实际应用”介绍:

猪和鸡都是重要的经济动物和理想的医学实验动物模型。高致病性猪蓝耳病(HPPRRS)、猪流感、高致病性禽流感(HPAI)与重症甲型H1N1流感、萨斯(SARS) 、西班牙流感一样,都是异常天然免疫应答性呼吸道RNA病毒病,其病原专嗜肺泡巨噬细胞(PAM)与淋巴细胞并造成严重损伤,对青壮年威胁更大,相关分子病理机制尚未阐明。而HPPRRS只是猪感染,用作异常天然免疫应答性呼吸道RNA病毒病研究模型则没有公共卫生问题限制。同时,临床上共感染普遍存在,特别是国内外资料表明猪圆环病病毒(PCV2)与猪蓝耳病病毒(PRRSV)共感染占猪共感染的50%以上,且免疫抑制与持续性感染因共感染而加重,相关机理尚不清楚。口蹄疫和猪瘟也是异常天然免疫应答性RNA病毒病,威胁很大。

本项目针对异常天然免疫应答性RNA病毒病,以SPF猪、鸡或其细胞作为研究模型,应用蛋白质组学、miRNA组学与系统生物学的策略和技术,分析SPF动物从正常到感染发病再到出现典型症状的过程中蛋白质与 miRNA分子演化网络的遗传基础并绘制图谱,筛选与这些病毒感染相关的目标蛋白质和miRNA;然后在细胞水平干预目标蛋白质和miRNA,研究其在病毒感染过程中的作用,阐明目标蛋白质和miRNA在病毒感染中的分子机制,获得在发病机制中起支配性作用的蛋白谱和miRNA谱,用于疫苗研制、药靶鉴定、抗病育种和早期诊断检测。

目前针对畜禽流行病毒病的疫苗免疫效果不是很理想,而面向病毒病抗病传统的育种的努力受到诸多技术瓶颈的限制,这些都迫切要求我们着眼于长远目标,从宿主方面筛选并鉴定抗性或易感基因谱,探索重大疫病防控的育种新途径。拟采用以下两种途径筛选抗病新基因:第一、利用生物信息学、计算生物学与计算系统生物学技术,规模化筛选畜禽感染与免疫相关蛋白与miRNA基因;第二、利用异常天然免疫应答性RNA病毒病病原感染SPF猪、鸡或其细胞的蛋白质组与miRNA组差显数据的系统生物学分析,与全球公开的多物种功能基因组数据的比较基因组学及统合分析(Meta-Analysis),筛选出病毒抗性或易感性蛋白编码基因谱和miRNA基因谱。以上两种途径的最终目的即找到抗病基因、易感基因及调控基因。如此规模的筛选必然会得到相当数量相关基因,而这些基因是否能够在个体上表现出相应的功能,需要对其进行细胞与个体水平的抗病毒检测,最终确认筛选技术与鉴定标准的有效性。

本项目针对现阶段以及长期以来对我国养猪业造成严重危害的HPPRRSV和PCV2共感染,利用组学、生物芯片与分子生物学技术,筛选出HPPRRSV与PCV2共感染猪肺泡巨噬细胞(PAM)过程中相关蛋白质和miRNA,并借助生物信息学手段识别miRNA作用靶标,进一步研究重要蛋白和miRNA在病毒感染过程中的功能,为认识HPPRRSV 与PCV2共感染发病机制,特别是HPPRRSV对PAM专嗜性及严重损伤的分子机制打下基础,对验证异常天然免疫应答性呼吸道RNA病毒病重症肺损伤的分子调控机制假设可能产生重要的理论和实际意义,同时获得HPPRRSV和PCV2共感染支配性蛋白谱和miRNA谱,用于药靶鉴定、抗病育种和早期诊治。本项目的完成对畜禽重大病毒病及共感染的防治具有实际指导意义,对类似RNA病毒病的发病机理研究提供重要的理论依据。

生物信息学与系统生物学简介:

生物信息学是新世纪最有发展前景的科技前沿交叉领域,投资少,见效快。

系统生物学是在细胞、组织、器官和生物体整体水平研究结构和功能各异的各种分子及其相互作用,并通过计算生物学来定量描述和预测生物功能、表型和行为。系统生物学将在基因组序列的基础上完成由生命密码到生命过程的研究,这是一个逐步整合的过程,由生物体内各种分子的鉴别及其相互作用的研究到途径、网络、模块,最终完成整个生命活动的路线图。系统生物学是综合各种组学测定结果,用计算生物学方法整合,用细胞与分子生物学验证,在分子水平上逼近生物体实际的21世纪生物学。病毒感染、免疫与肿瘤的系统生物学研究必然是解决重大疾病防治问题及基础研究的最新务实选择。

官方网站: https://210.27.80.44/tutorintroduction/tutorDetail.do?teacherId=214535https://dyxy.nwsuaf.edu.cn/newsite/jianli.php?clu_id=20&art_id=24

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