技术分享 | 如何快速预测分泌蛋白?一起来Get吧!

2018-12-19 11:11 · oebiotech

分泌蛋白分泌蛋白是指在细胞内合成后,分泌到细胞外起作用的一类蛋白质。常见的分泌蛋白有:唾液淀粉酶、胃蛋白酶、抗体和部分激素等。蛋白质分泌是细胞间进行信息传递的重要方式之一。一般的分泌蛋白在其N端都具有信号肽序列,可以通过经典的内质网/高尔基

分泌蛋白

分泌蛋白是指在细胞内合成后,分泌到细胞外起作用的一类蛋白质。常见的分泌蛋白有:唾液淀粉酶、胃蛋白酶、抗体和部分激素等。

 

蛋白质分泌是细胞间进行信息传递的重要方式之一。一般的分泌蛋白在其N端都具有信号肽序列,可以通过经典的内质网/高尔基体途径进行运输,并最终分泌到细胞外,被称为经典分泌蛋白;而近年来发现细胞内存在着另一类分泌蛋白,它们能够分泌到细胞外发挥功能,却没有典型的信号肽序列,这类具有独特分泌机制的蛋白被称为非经典分泌蛋白。

 

那么,如何对这些分泌蛋白进行预测呢?  

经典分泌蛋白预测

满足有信号肽但无跨膜结构域的蛋白 → 经典分泌蛋白

 

信号肽预测软件:SignalP

跨膜区预测软件:TMHMM

 

两款软件都有本地和在线两种版本,下面就来分别给大家介绍一下使用方法吧~

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