肥胖是目前全球性的普遍现象。由于过去缺乏有效的高通量技术手段限制了附睾组织的蛋白成分的研究,导致对其因衰老和高脂肪饮食引起的代谢和蛋白网络变化的认知非常有限。
今天分享的文章,在原有的基础上进行实验设计和数据分析改进,采用了多组TMT共20个生物学重复,对长期高脂肪饮食组与短期高脂肪饮食组,和不同年龄间高脂肪饮食组与低脂肪饮食组的蛋白进行比较。研究发现多种蛋白的变化,分别参与了脂肪代谢,氨基酸代谢,免疫应答,凋亡等通路。为附睾组织蛋白质组学研究提供了一个简单,可重复的分析方法。
材 料:附睾组织
主要技术:TMT
期 刊:Mol Cell Proteomics
影响因子:6.5399
实验流程
点评
在研究组织样本蛋白质组学中,本文的研究思路、技术方法和分析都是比较突出的一个案例。在模型代谢指标筛选方面做了比较全面的代谢检测,包括胰岛素耐受,乳糖耐受等,同时在蛋白质组学实验设计方面对样本分组与重复性做的比较到位。一共用了3组10标TMT,由此得到的数据比较详实,有利于后续数据分析。
文献来源
Plubell D. et al., Extended multiplexing of TMT labeling reveals age and high fat diet specific proteome changes in mouse epididymal adipose tissue. 2017, Mol Cell Proteomics.
相关链接
https://www.mcponline.org/content/16/5/873.abstract?sid=d4474c08-a130-4473-8484-218228859cb9