骨骼是脊椎动物内的坚硬器官,具有保护、支持、造血、储存和运动的功能,骨骼的发育至关人体的身心健康。骨骼的发育是极其复杂的一个过程,具有众多调控因子参与其中。目前,已有大量研究表明,有一种转录因子—Runx2,就参与到骨骼的发育过程中,它在肥大软骨细胞中表达活跃,并在软骨细胞发育为成骨的过程中发挥着至关重要的作用。Runx2基因沉默的小鼠体内明显缺乏矿物丰富的组织,并且骨骼的生长发育明显受到阻碍。在人体中,Runx2的表达异常,会致颅骨锁骨发育不良。为了探寻和Runx2共同发挥作用的互作蛋白,有篇文章采用酵母双杂交的技术来寻求答案,并最终获得与Runx2互作的蛋白。
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作者首先在NCBI上找到小鼠Runx2基因的序列信息。它共计9个外显子,编码区在第2到第9个外显子上,随后作者把ORF区域构建到pGBKT7载体上。
A:Runx2基因外显子信息;B:pGBKT7-Runx2载体的构建
为了证实构建的pGBKT7-Runx2载体可以正常表达,并且不会对酵母的生长产生毒性影响,作者将其转化进酵母,在SD/-Trp的平板上进行涂板验证。发现酵母生长正常,即表示载体构建成功。
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随后作者对库质粒cDNA进行LD-PCR检测(所用引物为特殊的随机引物—CDSIII/6),共计两种cDNA,来源于肥大区域软骨细胞及MCT细胞的总RNA反转录。结果显示,大部分PCR产物在500bp附近。然后将这些文库质粒同pGBKT7-Runx2载体进行共转,筛选出在SD/-Leu-His-Trp-Ade/ABA/X-ɑgal平板上生长的阳性克隆。
A:LD-PCR结果;B:Prey载体与Bait载体进行共转;C:筛选得到的阳性克隆
抽提阳性克隆的质粒,通过ADLD-PCR检测插入片段的大小,并将PCR产物纯化,然后进行测序,获得其序列信息。通过对比NCBI/GenBank数据库的信息,作者筛选出几个潜在的转录因子,包括Col1a2, Edf1(Endothelial differentiation factor), Lgals1 (Lectin, galactose binding, soluble 1-1), and Timp-2。随后作者在GenePaint上寻求这些基因的表达情况,并和肥大软骨细胞特异表达基因—Col10a1进行对比,发现这些基因表达均不相同,Col10a1作为阳性对照表达最强,Lgals1表达较强,Col10a2表达较弱,而Edf1表达最弱。
GenePaint数据库上显示的不同候选基因表达情况
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最后,作者通过RNA半定量和定量(qRT-PCR)的实验检测在增殖的MCT细胞和肥大的MCT细胞中这些候选基因的表达情况,发现阳性对照Col10a1在两种类型的MCT细胞中表达差异最大,Timp-2和Lgals1也存在明显的表达差异,但Timp-2的差异更为明显。
A:候选基因表达半定量结果;
B:候选基因表达定量结果(32℃:MCT细胞处于增殖状态;37℃:MCT细胞处于肥大状态)
作者通过酵母双杂交的技术筛选到与Runx2互作的蛋白Timp-2,并且其表达情况与阳性对照Col10a1的表达情况最为类似,故作者得出结论,Timp-2蛋白可能与Runx2一起参与到骨骼发育过程中,为骨骼发育的机制做出了进一步的阐释。
- 参考文献 -
YFeifei Li, Rui Mi, Chuling Fan, Ping Zhang ,et al. Runx2-interacting genes identified by yeast two-hybrid screening of libraries generated from hypertrophic chondrocytes. Am J Transl Res 2016;8(12):5465-5474