疟原虫基因组测序揭示抗疟的挑战与机遇

2012-08-08 08:00 · Hebe

两个国际研究小组通过最新疟疾基因组测序,揭示了新出现的基因变异,指出今后在根除疟疾之战中所面临的挑战,同时绘制出更为清晰详细的疟原虫基因图谱,为开发抗疟药物和疫苗奠定了基础。相关研究以两篇论文形式发表在最新出版的《Nature Genetics》杂志上。

两个国际研究小组通过最新疟疾基因组测序,揭示了新出现的基因变异,指出今后在根除疟疾之战中所面临的挑战,同时绘制出更为清晰详细的疟原虫基因图谱,为开发抗疟药物和疫苗奠定了基础。相关研究以两篇论文形式发表在最新出版的《Nature Genetics》杂志上。

研究集中在一种名为间日疟原虫的疟原虫上,是非洲以外最普遍的致疟疾寄生虫,流行于亚洲和中、南美洲潮湿的热带区域。间日疟原虫感染的疟疾会导致多次复发的严重失能性疾病,甚至死亡。测定间日疟原虫基因组序列有助于研究其基因变异,确定新药及疫苗开发的基因标靶。

“坏消息是间日疟原虫出现了大量基因变异,变异让它们变得非常老练,能避开我们发出的多种药物和疫苗的联合攻击。”两篇论文的高级作者、纽约大学基因组学与系统生物学中心的简·卡尔顿说,“但现在我们对所面临的挑战有了更多了解,能更深入地分析它的基因变异,以找到更有效的治疗措施。”

在其中一篇论文中,研究人员检查了来自西非、南美和亚洲多个地理区域的间日疟原虫类型,首次从基因组角度揭示了这种疟原虫在全球的分布变化。分析显示,间日疟原虫的基因多样性是一种在全世界普遍存在的恶性疟原虫的两倍,还显示出它们有超乎人们预料的进化能力,这为开发新疗法带来了挑战。

第二篇论文中,研究人员首次完成了对食蟹猴疟原虫的基因组测序。鉴别了它的基因多样性,并将它的基因组和间日疟原虫、诺氏疟原虫作了比较,这有助于今后进一步理解并抵抗各种疟疾的形成。诺氏疟原虫能对东南亚部分地区的猴子和人类造成感染,此前已经过测序。食蟹猴疟原虫与间日疟原虫具有基因相似性,“我们绘制了食蟹猴疟原虫的基因图谱,它是间日疟原虫的姐妹种类,现在我们能构建出更完善的模型系统来研究间日疟原虫。”

编辑圈点

用道高一尺魔高一丈这句话来形容疟原虫也许恰如其分。虽然人类与其抗争已半世纪有余,但每年全球仍有超过两亿人感染疟疾。科学家的最新发现揭示了这场抗争胜负的原因:虽然医疗水平不断提升,但疟原虫超乎预料的基因突变和进化能力,使它总能通过改变自身基因特性躲避药物的打击。可以预见人类与疟疾的这场对抗将旷日持久。

1) Plasmodium cynomolgi genome sequences provide insight into Plasmodium vivax and the monkey malaria clade.

Shin-Ichiro Tachibana,  Steven A Sullivan,  Satoru Kawai,  Shota Nakamura,  Hyunjae R Kim,  Naohisa Goto,  Nobuko Arisue.    

abstract:P. cynomolgi, a malaria-causing parasite of Asian Old World monkeys, is the sister taxon of P. vivax, the most prevalent malaria-causing species in humans outside of Africa. Because P. cynomolgi shares many phenotypic, biological and genetic characteristics with P. vivax, we generated draft genome sequences for three P. cynomolgi strains and performed genomic analysis comparing them with the P. vivax genome, as well as with the genome of a third previously sequenced simian parasite, Plasmodium knowlesi.[文献链接]

2) The malaria parasite Plasmodium vivax exhibits greater genetic diversity than Plasmodium falciparum.

Daniel E Neafsey,  Kevin Galinsky,  Rays H Y Jiang,  Lauren Young,  Sean M Sykes,  Sakina Saif, Sharvari Gujja,  Jonathan M Goldberg,  Sarah Young,  Qiandong Zeng,  Sinéad B Chapman,  Aditya P Dash,  Anupkumar R Anvikar.  

abstract:We sequenced and annotated the genomes of four P. vivax strains collected from disparate geographic locations, tripling the number of genome sequences available for this understudied parasite and providing the first genome-wide perspective of global variability in this species.[文献链接]