Nat.Genetics:发现6个新的银屑病易感基因

2010-10-18 00:00 · Prima

生物谷导读:10月18日,安徽医科大学皮肤科研究所张学军教授团队联合了美国密歇根大学、华盛顿大学,德国吉尔大学和复旦大学华山医院等国内外30多家单位共同在线发表中外科学家合作研究发现6个新的银屑病易感基因的研究成果。 张学军介绍 Nature Genetics:发现牛皮癣易感

10月18日,安徽医科大学皮肤科研究所张学军教授团队联合了美国密歇根大学、华盛顿大学,德国吉尔大学和复旦大学华山医院等国内外30多家单位共同在线发表中外科学家合作研究发现6个新的银屑病易感基因的研究成果。

张学军介绍

Nature Genetics:发现牛皮癣易感基因

Nature Genetics:汉族人红斑狼疮易感基因

Nature Gentics:GWAS发现白癜风易感基因

高烧的GWAS――生物谷盘点2009

牛人在我身边(1)

2009年初,安徽医科大学皮肤病研究所张学军教授研究团队通过全基因组关联分析(Genome Wide Association Study,GWAS)方法,在国际上首次发现银屑病易感基因LCE。之后,他们通过深入分析数据,联合欧美银屑病遗传研究团队,采用多中心、多种族、大样本,在30000余份银屑病和对照中继续开展易感基因深层发掘,进一步发现了6个银屑病新的易感基因;并发现其中3个基因在中国人群、美国人群和德国人群银屑病易感性的异同;2个基因与早发型银屑病密切相关;提出了银屑病发病的遗传异质性。

据介绍,这项研究得到国家自然科学基金重点项目、国家“973”计划项目、“863”计划项目和美国NIH项目支持。研究实现了亚洲人群、欧美人群的国际性合作,突破了疾病易感基因研究人群单一的局限,研究结果具代表性和科学性。

同时,由于目前国际上已经发现并被广泛公认的银屑病易感基因近20种,本次发现6个新易感基因,对于构建银屑病易感基因谱,深入了解银屑病的发病机制将起到积极推动作用,也为疾病预警、遗传咨询、临床诊疗、新药开发等提供了科学依据。

GWAS是目前国际上公认的搜寻和鉴定复杂疾病易感基因的研究方法。近5年来,中外科学家通过GWAS研究,在近200种包括肿瘤、精神疾病、代谢疾病、免疫疾病、传染病等复杂疾病中发现近3000个疾病易感基因,推动了人类对复杂疾病遗传学发病机制的认识。

安医大皮肤病研究所从2007年开始在国内开展复杂疾病GWAS研究,先后利用GWAS在国际上首次发现汉族人银屑病、白癜风、麻风、系统性红斑狼疮等皮肤复杂疾病易感基因,深入揭示了这些复杂疾病的分子发病机制,使我国银屑病、白癜风、麻风和系统性红斑狼疮等皮肤复杂疾病易感基因研究处于世界领先水平行列。

 

英文摘要:

Nature Genetics doi:10.1038/ng.690

Association analyses identify six new psoriasis susceptibility loci in the Chinese population

Liang-Dan Sun,Hui Cheng,Zai-Xing Wang,An-Ping Zhang,Pei-Guang Wang,Jin-Hua Xu,Qi-Xing Zhu,Hai-Sheng Zhou,Eva Ellinghaus,Fu-Ren Zhang,Xiong-Ming Pu,Xue-Qin Yang,Jian-Zhong Zhang,Ai-E Xu,Ri-Na Wu,Li-Min Xu,Lin Peng,Cynthia A Helms,Yun-Qing Ren,Chi Zhang,Shu-Mei Zhang,Rajan P Nair,Hong-Yan Wang,Guo-Shu Lin,Philip E Stuart,Xing Fan,Gang Chen,Trilokraj Tejasvi,Pan Li,Jun Zhu,Zhi-Ming Li,Hong-Mei Ge,Michael Weichenthal,Wen-Zheng Ye,Cheng Zhang,Song-Ke Shen,Bao-Qi Yang,Yuan-Yuan Sun,Shan-Shan Li,Yan Lin,Jian-Hua Jiang,Cun-Tao Li,Ri-Xin Chen,Juan Cheng,Xin Jiang,Peng Zhang,Wei-Min Song,Jin Tang,Hao-Qin Zhang,Li Sun,Jing Cui,Li-Jun Zhang,Biao Tang,Fei Huang,Qian Qin,Xiao-Ping Pei,Ai-Min Zhou,Li-Mei Shao,Jian-Lan Liu,Feng-Yu Zhang,Wei-Dong Du,Andre Franke,Anne M Bowcock,James T Elder,Jian-Jun Liu,Sen Yang" Xue-Jun Zhang

We extended our previous genome-wide association study for psoriasis with a multistage replication study including 8,312 individuals with psoriasis (cases) and 12,919 controls from China as well as 3,293 cases and 4,188 controls from Germany and the United States and 254 nuclear families from the United States. We identified six new susceptibility loci associated with psoriasis in the Chinese study containing the candidate genes ERAP1, PTTG1, CSMD1, GJB2, SERPINB8 and ZNF816A (combined P & 5 × 10?8) and replicated one locus, 5q33.1 (TNIP1-ANXA6), previously reported (combined P = 3.8 × 10?21) in the European studies. Two of these loci showed evidence for association in the German study at ZNF816A and GJB2 with P = 3.6 × 10?3 and P = 7.9 × 10?3, respectively. ERAP1 and ZNF816A were associated with type 1 (early onset) psoriasis in the Chinese Han population (test for heterogeneity P = 6.5 × 10?3 and P = 1.5 × 10?3, respectively). Comparisons with the results of previous GWAS of psoriasis highlight the heterogeneity of disease susceptibility between the Chinese and European populations. Our study identifies new genetic susceptibility factors and suggests new biological pathways in psoriasis.

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