Science:三大主要蚊子基因组测序完成

2010-10-08 00:00 · Hebe

科学家们已经测定了三大主要的致病蚊子中的第三种蚊子的基因组序列。 人们已经知道了伊蚊(Aedes aegypt)和按蚊(Anopheles gambiae)的基因组;此次新被测序的是库蚊(Culex quinquefasciatus),它也被称作南方居所蚊虫(southern h

科学家们已经测定了三大主要的致病蚊子中的第三种蚊子的基因组序列。 人们已经知道了伊蚊(Aedes aegypt)和按蚊(Anopheles gambiae)的基因组;此次新被测序的是库蚊(Culex quinquefasciatus),它也被称作南方居所蚊虫(southern house mosquito)。 这种蚊子是携带诸如西尼罗病毒及圣路易脑炎病毒等的一种重要的媒介,它也是携带可导致淋巴丝虫病的线虫的媒介。 在这三个蚊属中,库蚊是最具多样性而且地理分布最广的蚊子,而对其基因组的测序揭露了库蚊与其它蚊子之间存在的某些有趣的差异。 通过比较这三种蚊子的基因组,研究人员可能会发现控制蚊虫传播疾病的新线索,或者反过来说,他们可能会找出令人们难以控制这些不同品种的蚊子之间所存在的差别。

根据Peter Arensburger及其同事撰写的第一篇文章披露,库蚊的基因组中有1万8883个能够编码蛋白质的基因,这一数字比伊蚊要多22%,比按蚊要多52%。 有数个基因家族有所扩大,其中包括那些与嗅觉和味觉受体有关的基因以及与唾液腺和免疫系统功能有关的基因。 这些扩大的基因家族可能反映了库蚊可以吸食鸟类、人类和牲畜类血液的这一事实。 在第二篇文章中,Lyric Bartholomay及其同事更深入地探索了库蚊中的感染反应基因。 他们揭示了库蚊中有500个免疫反应相关基因,其中有些与伊蚊的类似,但它们比按蚊或黑腹果蝇的相关基因要少。 有数个基因的扩展与其对不同栖息地的适应性改变有关,其中包括常常能够发现库蚊的受到污染的、城市化的环境。

 

英文摘要:

Science DOI: 10.1126/science.1191864

Sequencing of Culex quinquefasciatus Establishes a Platform for Mosquito Comparative Genomics

Peter Arensburger,1,* Karine Megy,2 Robert M. Waterhouse,3,4 Jenica Abrudan,5 Paolo Amedeo,6 Beatriz Antelo,7 Lyric Bartholomay,8 Shelby Bidwell,9 Elisabet Caler,6 Francisco Camara,9 Corey L. Campbell,10 Kathryn S. Campbell,11 Claudio Casola,12 Marta T. Castro,13 Ishwar Chandramouliswaran,6 Sinéad B. Chapman,14 Scott Christley,5 Javier Costas,15 Eric Eisenstadt,6 Cedric Feschotte,16 Claire Fraser-Liggett,17 Roderic Guigo,9 Brian Haas,14 Martin Hammond,2 Bill S. Hansson,18 Janet Hemingway,19 Sharon R. Hill,20 Clint Howarth,14 Rickard Ignell,20 Ryan C. Kennedy,5 Chinnappa D. Kodira,21 Neil F. Lobo,5 Chunhong Mao,22 George Mayhew,23 Kristin Michel,24 Akio Mori,5 Nannan Liu,25 Horacio Naveira,26 Vishvanath Nene,17,27 Nam Nguyen,16 Matthew D. Pearson,14 Ellen J. Pritham,16 Daniela Puiu,28 Yumin Qi,22 Hilary Ranson,19 Jose M. C. Ribeiro,29 Hugh M. Roberston,30 David W. Severson,5 Martin Shumway,29 Mario Stanke,31 Robert L. Strausberg,6 Cheng Sun,16 Granger Sutton,6 Zhijian (Jake) Tu,22 Jose Manuel C. Tubio,7 Maria F. Unger,5 Dana L. Vanlandingham,33 Albert J. Vilella,2 Owen White,17 Jared R. White,14 Charles S. Wondji,19 Jennifer Wortman,17 Evgeny M. Zdobnov,3,4,33 Bruce Birren,14 Bruce M. Christensen,23 Frank H. Collins,5 Anthony Cornel,32 George Dimopoulos,35 Linda I. Hannick,6 Stephen Higgs,33 Gregory C. Lanzaro,34 Daniel Lawson,2 Norman H. Lee,36 Marc A. T. Muskavitch,14,37,38 Alexander S. Raikhel,1 Peter W. Atkinson1

Culex quinquefasciatus (the southern house mosquito) is an important mosquito vector of viruses such as West Nile virus and St. Louis encephalitis virus, as well as of nematodes that cause lymphatic filariasis. C. quinquefasciatus is one species within the Culex pipiens species complex and can be found throughout tropical and temperate climates of the world. The ability of C. quinquefasciatus to take blood meals from birds, livestock, and humans contributes to its ability to vector pathogens between species. Here, we describe the genomic sequence of C. quinquefasciatus: Its repertoire of 18,883 protein-coding genes is 22% larger than that of Aedes aegypti and 52% larger than that of Anopheles gambiae with multiple gene-family expansions, including olfactory and gustatory receptors, salivary gland genes, and genes associated with xenobiotic detoxification.

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