上海交大发现肝癌相关重要lncRNA

2015-06-24 11:22 · JimmyFrank

最新一期Cancer Research中报道了上海交通大学医学院附属瑞金医院对肝癌预后相关lncRNA研究最新成果。

  肝癌是我国多发的一种恶性癌症,虽然肝癌的诊断和治疗技术发展迅速,但依然有很多盲区。近些年来,lncRNA作为潜在的基因表达和细胞过程的重要调控者,获得了巨大的关注。最新一期Cancer Research中报道了上海交通大学医学院附属瑞金医院对肝癌预后相关lncRNA研究最新成果。

   研究者首先利用已公开的GEO数据库及两种lncRNA芯片数据,筛选得到肝癌组织中58个上调的和3个下调的lncRNA,再通过建立共表达网络,最 终确认所有出现差异的lncRNA中,上调最为明显的ZFAS1为筛选得到的关键lncRNA。在细胞及小鼠体内上调ZFAS1时,肝癌细胞侵袭性及迁移 性明显增强,临床病例分析也表明,ZFAS1失调与肝癌较差预后明显相关。这些结果也充分证明了之前分析结果。

ZFAS1动物体内过表达对肝癌细胞迁移能力的影响

     接下来,研究者对ZFAS1促进肝癌细胞迁移的原因进行了探索。生物信息学分析表明,ZFAS1序列上有一个miR-150的结合位点,为了验证这个结合 位点,研究者构建了一个特殊的ZFAS1重组转录本,该转录本能与MS2bp和GFP形成一个复合体,通过对此复合体进行RIP及RNA pull down实验确认,ZFAS1确实会作为一个ceRNA结合miR-150,从而影响miR-150对ZEB1、MMP14和MMP16三个基因的调控, 造成三个基因表达上调,ZFAS1沉默及过表达实验证明了ZEB1与这三个基因的正相关关系。

研究者构建了一个携带有MS2结合蛋白(MS2 binding protein,MS2bp)互作位点的ZFAS1重组转录本,让此转录本结合MS2bp和GFP,形成一个复合体,利用GFP抗体进行RIP实验。结果 表明,携带有WT型miR-150结合位点的ZFAS1重组转录本可以明显富集miR-150,但mut型则无法富集miR-150。

利用生物素标记的WT型miR-150进行RNA pull-down实验,结果表明只有WT型miR-150可以富集ZFAS1,表明ZFAS1确实可以与miR-150结合

    本项研究,发现了肝癌细胞侵袭及转移相关的一个重要lncRNA——ZFAS1,并阐明了该lncRNA功能通路,接下来,研究者将进一步对ZFAS1在 肝癌细胞中失调的具体原因进行进一步探索,以期在未来能够以此lncRNA为肝癌诊断及治疗靶点,开发新的治疗方法。

   相关论文:Zhecheng Z, Li T, Xie J, et al. Amplification of long non-coding RNA ZFAS1 promotes metastasis in hepatocellular carcinoma[J]. Cancer research, 2015: canres. 3721.2014.


关键词: lncRNA