干细胞（Stem Cells）被称作人体组织细胞的自然蓄水池，拥有自我复制（自更新）和随时分化成其它更专业化功能细胞的独特能力，如此成为医学科技人员治疗一系列疾病和人体组织损伤强有力的技术工具。然而干细胞研究并非没有争论，特别是胚胎干细胞研究，已在科技界以及更广泛的社会各界引发争议。
欧盟干细胞研究正处于勃勃生机的“开花结果”阶段，尽管部分研究仍处于前沿的科学探索，但系列的主要研究活动已转向应用研究或商业化应用开发前期。例如，通过观察控制干细胞，欧盟科技人员已实现准确的干细胞专业化功能开发，可广泛应用于治疗重大疾病，如癌症或细胞异常分裂与分化引发的先天性缺陷疾病。
目前，欧盟干细胞研究的商业化应用，主要针对人体受损细胞替代的疾病治疗，包括大面积烧伤、白血病患者的血液系统修复和心血管系统医疗。正在开展干细胞直接分化成专业化功能细胞类型，进行治疗包括帕金森疾病（Parkinson’s）、中风、心脏病和糖尿病在内的临床试验。
欧盟第七研发框架计划（FP7）和欧盟2020地平线（Horizon 2020），是欧盟层面资助干细胞研究的最主要平台。目前资助的干细胞研究研发创新项目主要包括：应用干细胞开发神经功能化细胞；干细胞修复中风损伤细胞；干细胞应用技术、工具、标准开发及社会文化普及；干细胞毒理学筛选技术；干细胞融合技术治疗帕金森疾病；和负责任的干细胞科研与创新；等等。
