近日，一篇发表在英国《皇家学会会刊B辑：生物科学》上的文章首次利用大范围下一代DNA测序技术揭秘蝴蝶进化史，利用大量基因数据回答了有关蝴蝶与飞蛾进化史的问题。“一场DNA的革命正在发生，这是科学史上的重大时机，现在我们能在大范围上应用DNA测序技术。”河原秋田说，也正说明了NGS在群体进化分析上的优势。
产品简介
群体进化分析是对同一物种的不同亚群，或不同地理分布的品种进行全基因组测序或者基于酶切的简化基因组测序，通过与参考序列比对，获得大量高准确性的SNP、InDel、SV等变异信息，研究生物群体中的基因频率和基因型频率，讨论群体的遗传结构、遗传平衡和影响群体遗传平衡的因素，从而从分子层面揭示该物种的进化机制、环境适应性等系列问题。
技术流程
适用范围
1. 同一物种中的不同亚群，或不同地理分布的品种（自然群体）
2. 各亚群间划分明显，同一亚群内的个体有一定代表性
3. 每个亚群选取10个样本以上（建议动物≥10个，植物≥15个），总体不少于30个样本。（测序深度≥5X/个体）
产品优势
1. 信息精准全面，最大程度挖掘出群体内遗传变异
2. 项目经验丰富，研究成果持续发表于高影响因子杂志
表1 诺禾致源群体进化分析研究成果一览表
应用案例
案例一 基于全基因组重测序的家猪和藏猪差异化选择群体进化分析
2013年，诺禾致源科技服务团队与四川农业大学李学伟、李明洲两位教授合作，利用高通量测序技术及生物信息分析策略，从基因组水平充分揭示了藏猪特有的高原环境适应性的分子机理，同时解析了四川盆地家猪在几千年的人工驯化过程中基因组中重要经济性状相关基因的进化方向。
本研究采用全基因组de novo测序，绘制完成高质量的藏猪基因组序列图谱：全长为2.43Gb，contig N50达到20.6 Kb，scaffold N50达到1.06M。同时，通过比较基因组学和群体遗传学分析，在藏猪基因组中鉴定出3000多个与心肺血液循环、疾病抵抗、紫外抗性相关的特有基因，揭示了藏猪高原适应性的分子机制。
图1 基因组系统进化树
图2 藏猪及四川盆地家猪群体选择性消除分析
参考文献
Li, M., Tian, S., Jin, L., Zhou, G.,Li, X., Li, R# . Genomic analysis identify distinct patterns ofselection in domesticated pigs and Tibetan wild boars. Nature Genetics, 2013.
