宏基因组,放“价”归来!

2014-09-25 14:39 · 诺禾致源

宏基因组测序(Metagenomics Sequencing)是以特定环境中的微生物群落作为研究对象,基于高通量测序平台,对环境微生物总DNA进行测序分析。

  • 活动细则

    买十送十,感恩回馈价:1万/样。

    全国限送100个,送完为止。

  • 活动时间:2014.10.01-2014.10.31

  • 针对10类典型环境:

    土壤、水体、淤泥、根系、肠道、口腔、胃、瘤胃、发酵液、酒糟

 

宏基因组测序:

宏基因组测序(Metagenomics Sequencing)是以特定环境中的微生物群落作为研究对象,基于高通量测序平台,对环境微生物总DNA进行测序分析。该技术摆脱了传统研究中微生物分离培养的技术限制,不但能够满足微生物群体的物种分类研究、群落结构,而且可以通过微生物群体基因组的组装与注释分析,来实现系统进化、基因功能以及物种间代谢网络的分析。

样品要求

  DNA浓度≥50 ng/μL;总量≥3μg;

OD 260/280=1.8-2.0;无RNA、蛋白质等杂质污染

测序策略

 HiSeq2500,PE125,5G raw data

文献分享

案例一:应用宏基因组学构建人类肠道基因集

人体微生物是人的第二套基因组,与健康息息相关。大多数微生物存在于肠道中,研究肠道的微生物对于人类健康、营养起着非常重要的作用。随着测序技术的发展,宏基因组逐渐成为研究复杂微生物结构的一个有力工具。该文为MetaHIT的一个子项目。采用宏基因组测序的方法对124个人样本(健康人,结肠炎患者,溃疡性肠炎患者)肠道微生物进行测序。将测序的数据组装后找到与肠道微生物相关的基因集,在此基础上对3种人群进行了肠道微生物结构的比较分析,并对找到的肠道微生物相关的基因集做注释(图1),从而推测这些微生物在肠道中的作用。 

参考文献

Qin J, Li R, et al. A human gutmicrobial gene catalogue established by metagenomic sequencing. Nature, 2010.464: 59-65.