
单分子基因测序是一个有成本效益、新的测序方法,可以使科学家更容易确认肿瘤细胞中致癌突变的种类。飞雨科技是马塞诸塞州比尔里卡的一个基因组工具制造商。通过其开发,这项技术可以使研究人员分析探针收集的微小样本,它的侵入性比需要多分子诊断测序的活检手术的更低。
利用液滴巧创新
医学研究员和医生越来越多的检测肿瘤DNA以跟踪癌症的进展,以识别新药物的分子靶位点,确定哪些现有的治疗方法对特定病人更适合。测序虽是分析基因突变最全面的方法,但很多肿瘤样本不适合,因为它们不含有足够的DNA,或是它们含有的DNA已被标准的加工方法破坏。
飞雨测序使用微小液体在DNA操纵反应通常发生的地方替代小塑料管,每个液滴的体积在八皮升左右,大约是百万分之一茶匙量。当液滴自飞雨机器中诞生,它们就包含了扩增一个已知癌基因的全部组件。然后,研究人员就可以将病人的DNA添加到液滴中,DNA将在液滴中进行复制反应。 样本DNA扩增后,研究人员可以使用标准设备确定基因的序列,或是利用飞雨本身的机器寻找癌基因。因为液滴及其微小,只需要极少量的试剂,所以使得过程比其他方法更便宜。
技术应用新突破
飞雨科技成立于2004年,为了使该技术成为商业化系统。首席技术官Darren Link作为哈佛博士后研究员时开发了此项技术。他最初开发此技术是为了研究材料物理学,但是他说:“随着微反应室这个词的传播,生物学家为研究单分子对其产生了极大兴趣。”
据飞雨CEO、波士顿 Dana Farber癌症研究所的前临床科学家Roopom Banerjee所说,飞雨技术只需要极少量的肿瘤DNA,这使得它独一无二,也使得从更多的肿瘤样本中测出DNA成为可能,还使得被化学固定剂保存过的样本测序也成为可能。他还说:“由于固定剂会分解DNA,所以很多DNA测序的方法都无法作用于这些样本,但飞雨技术可以完成一个基因单独的完整的拷贝。所以,目前存储在世界各地的生物库中的超过100万的癌症样本可以用于癌症研究了。”
虽然现在飞雨技术目前只提供给研究人员,不出售该技术给医生用于病人。但据Banerjee说,公司的研究客户可以用它开展内部测试。可能有一天,它可以使医生对从固体肿瘤获得的小数量细胞进行一系列的分子检测,甚至是在血液样本中本的构建浮板。
