6月20日汤森路透（Thomson Reuters）发布了2012年最新SCI影响因子名单，刊载了8411种SCI收录的期刊并按字母顺序排列以方便查阅。（影响因子名单下载）在医学类和生物学类中排在首位的分别是CA-CANCER J CLIN（153.459分）和NAT REV GENET（41.063分）。
影响因子取值于上一年收录期刊的总引用数和发表论文的比值，是评价期刊学术水平的重要参数，也是研究机构采用的评价科研成果的指标之一。
国内外顶级生物医药类期刊排名动态
2012年获得153.459分的《CA-CANCER J CLIN》（临床肿瘤学）杂志仍占据SCI影响因子名单的首位，它是美国癌症学会主办的同行评议的综述性期刊，内容涉及到肿瘤的诊断、预防和治疗。该期刊在2012年年发文量仅有25篇，凭借着高水平研究和学者深度评议以及定位肿瘤研究，其影响因子由2011年约100份飙升了近50分，遥遥领先于得分51.658的、处于第2位的 《EW ENGL J MED》（新英格兰医学）杂志。
在2012年SCI影响因子中，引人注意的是生物医药领域的《NAT REV GENET》（影响因子为41.063分）、《Nature》（影响因子为38.597分）和《Nature Biotechnology》（影响因子为32.438分），这三个影响因子提高的Nature系列期刊分别位于第三位、第五位和第十二位。但是Nature的一些综述性期刊在影响因子上出现了下滑迹象，《NAT REV MOL CELL BIO》和《NAT REV CANCER》杂志分别从2011年的42.508和38.460分下降到2012年的37.162和35分。
SCI收录的国内期刊整体影响因子不高，无法匹配于2012年中国在科研产生领域跻身世界前五强的事实，不过令人眼前一亮的是，《Cell Research》期刊2012年影响因子涨到了 10.526，其联合主办方是中国科学院上海生命科学研究院和中国细胞生物学学会。走在中国学术期刊最前沿的《Cell Research》让人喜出望外地突破10。而排在国内期刊第二位的是《Journal of Molecular Cell Biology》，其影响因子为7.308较去年略微降低；排在第三位的《Molecular Plant》是国际植物科学领域研究类期刊的第五位，并连续2年位居亚洲同领域期刊的首位。
生物医学类前十位学术期刊
排名 | 期刊名 | 影响因子 |
1 | CA-CANCER J CLIN | 153.459 |
2 | NEW ENGL J MED | 51.658 |
3 | NAT REV GENET | 41.063 |
4 | LANCET | 39.06 |
5 | NATURE | 38.597 |
6 | NAT REV MOL CELL BIO | 37.162 |
7 | ANNU REV IMMUNOL | 36.556 |
8 | NAT GENET | 35.209 |
9 | NAT REV CANCER | 35 |
10 | NAT REV IMMUNOL | 33.129 |
2012年引文最高的中国研究论文
论文质量一般由发文期刊的SCI影响因子决定，而与单篇的引用次数关联不大，不过，论文的引用次数在一定程度上能够反映出研究的热点和潮流，即热门方向的论文比较容易被引用，尤其是刚兴起的某个方向和交叉学科。
为了让科研人员了解中国机构的研究热点，汤森路透对中国研究论文的引用次数进行统计，只要论文作者从属于中国研究机构就可将论文归为中国研究机构，而不计较是否是第一作者或是通讯作者。从榜单中可看出，科学研究不再是一个研究机构所做的，而是跨国多机构协同完成；生物医学是中国科研机构的研究热点，多数上榜论文都集中在该领域，其中基因组学更具热度。
排在榜单第一位的、引用次数是414的论文“Observation of a new particle in the search for the Standard Model Higgs boson with the ATLAS detector at the LHC”有4家中国机构参与，它们分别是中科院高能物理研究所、中国科学技术大学、南京大学和山东大学。而排名第六的论文“An integrated encyclopedia of DNA elements in the human genome”是生物医药领域引用次数最多的，清华大学生命科学院是参与此研究的唯一的中国科研机构。
2012年中国高引用论文前十位
排名 | 引文 | 引文次数 |
1 | ATLAS Collaboration. Observation of a new particle in the search for the Standard Model Higgs boson with the ATLAS detector at the LHC. PHYSICS LETTERS B SEP 17 2012 | 414 |
2 | CMS Collaboration. Observation of a new boson at a mass of 125 GeV with the CMS experiment at the LHC. PHYSICS LETTERS B, SEP 17 2012; DOI: 10.1016/j.physletb.2012.08.021 | 384 |
3 | An, F. P.; Bai, J. Z.; Balantekin, A. B.; et al. Observation of Electron-Antineutrino Disappearance at Daya Bay. PHYSICAL REVIEW LETTERS, APR 23 2012; DOI: 10.1103/PhysRevLett.108.171803 | 268 |
4 | CMS Collaboration. Combined results of searches for the standard model Higgs boson in pp collisions at root s=7 TeV. PHYSICS LETTERS B, MAR 29 2012; DOI: 10.1016/j.physletb.2012.02.064 | 263 |
5 | ATLAS Collaboration. Combined search for the Standard Model Higgs boson using up to 4.9 fb(-1) of pp collision data at root s=7 TeV with the ATLAS detector at the LHC. PHYSICS LETTERS B, | 260 |
6 | ENCODE Project Consortium. An integrated encyclopedia of DNA elements in the human genome. NATURE, SEP 6 2012; DOI: 10.1038/nature11247 | 222 |
7 | Zhang, Ying; Crous, Pedro W.; Schoch, Conrad L.; et al. Pleosporales. FUNGAL DIVERSITY, MAR 2012; DOI: 10.1007/s13225-011-0117-x | 159 |
8 | ATLAS Collaboration. Search for squarks and gluinos using final states with jets and missing transverse momentum with the ATLAS detector in root s=7 TeV proton-proton collisions. PHYSICS LETTERS B, | 112 |
9 | CMS Collaboration. Search for the standard model Higgs boson decaying into two photons in pp collisions at root s=7 TeV. PHYSICS LETTERS B, APR 12 2012; DOI: 10.1016/j.physletb.2012.03.003 | 100 |
10 | Park, Sung-Jun; Ahmad, Faiyaz; Philp, Andrew; et al. Resveratrol Ameliorates Aging-Related Metabolic Phenotypes by Inhibiting cAMP Phosphodiesterases. CELL, FEB 3 2012; | 94 |
66家期刊被删除2012年影响因子
出于对影响因子潜规则操作的紧迫关注，科学出版社（Science publishers）将严肃处理期刊论文自引文过多的问题。66 家期刊自引文或期刊之间相互引文过多而从2012年影响因子列表中删除，其中点名批评的包括《International Journal of Crashworthiness》 和 《 Iranian Journal of Fuzzy Systems》这两家。
之前受到同样处理的有2011年的51家（28家新违规）和2010年的34家。汤森路透曾于2011年统计出，140家期刊在过去2年间具有70%以上的自引文，而作为对照的是，另外五分之四的期刊将这一比例控制在30%以下。此外，从2012年列表中删除这一创纪录的期刊数，汤森路透认为最核心原因是因自引文而歪曲排名。
对待66家期刊除名的处罚，大多数期刊处于漠不关心和忧虑过重之间，其主编仍迫切地希望他们期刊的影响因子不断创下新高。即便意识到影响因子仅反映期刊的平均引文量而与期刊内相互引文无关这一事实，他们仍不重视多次提到的影响因子的正规引文来源。（被删除2012年影响因子的66家期刊）
