让DNA结构设计随心所欲:DNA纳米技术提供药物投递的分子平台

2013-03-25 10:49 · johnson

美国亚利桑那州立大学颜颢教授领导的研究小组研发出能解决纳米构件设计难题的新方法,可按照研究人员意愿制造模块结构,用于提高药物输送效率、单分子传感器以及可编程的分子机器人,从而推动DNA纳米技术新兴领域的发展。

来自美国亚利桑那州立大学的研究人员在一项最新成果中,获得了解决一种关键设计难题的新办法,这将能令研究人员生成各种各样的2维和3维结构,从而推动DNA纳米技术新兴领域的发展。


领导这一研究的是亚利桑那州立大学颜颢教授,颜颢早年毕业于山东大学,这位以自己独特的技术成果在学术界打出一片天空的华裔科学家,多年来在Science,Nature杂志上发表了多项重要的成果,备受关注。

DNA不仅仅是生命的密码,它还是制造纳米级构件和设备的通用元件。通过现代生物技术,我们可以制造出很长的DNA分子,上面排列着根据意愿选择的构建模块序列,这为DNA的应用开辟了广阔的新天地,而不仅限于自然界中生物进化的领域。

颜颢的研究小组就利用结构DNA纳米技术(利用了DNA作为遗传信息编码聚合物的优点,通过DNA分子卓越的自组装和识别能力实现精确的纳米构架,就如同纳米机械在工作一样),构建了许多重要的结构,如特洛伊木马结构——用以提高药物输送到癌细胞的效率,导电金纳米线,单分子传感器和可编程的分子机器人。

现在他们又继续在分子水平上探索着这些结构的几何和物理限制。“这一领域的研究人员对于构建线性或者网状的结构,十分感兴趣,”颜颢说,“我们需要研发出新的设计思路,来构建更加复杂的三维结构。”

在最新这项研究中,他们完成了类似线框,分子镊子,剪刀,螺丝,手风扇,甚至是一张蜘蛛网之类的2维和3维结构,十分有趣。这一研究成果公布在3月22日出版的Science杂志上。

通过一种“自下而上”扭曲技术,研究人员将分子乐高设计的关键点聚焦于一种称为Holliday交叉(Holliday junction,HJ)的DNA结构上。在自然界中,这种十字形,双叠DNA结构就像是遗传机制中的十字路口,两个独立的DNA螺旋能用于交换遗传信息。Holliday交叉带来了地球上各种各样的生物,并确保后代具有来自母亲和父亲DNA信息的独特重组。

在自然界里,Holliday交叉能以约60度角的角度扭曲双叠DNA链,这是交换基因的一个完美角度,但有时对于DNA纳米技术的科学家来说,这并不是好消息,因为这限制了其结构的设计规则。

“原则上,你可以利用这个支架横向连接多个层,”然而,当你需要构建垂直方向结构时,DNA的极性就会导致无法构建多层,“我们需要做的是把这个角度旋转过来,进行力量连接”。


研究人员通过改变每个Holliday交叉之间DNA的长度,使得Holliday交叉中几何形状发生了非常规的重排,令这个交叉更加灵活,并首次能在垂直方向上构建结构。颜教授将其称为烧烤架形状,DNA烧烤架。

“我们惊讶的发现这能奏效!”他说,“一旦能完成这样的工作,那么就很容易进行新的设计了。如果你被传统规则所束缚,就很难走出新的一步,一旦你走出了这一步,形势就变得明确了。”

DNA搭出”上百种三维纳米结构成亮点

美国哈佛大学维斯生物工程研究院的科学家用DNA“砖块”造出了100多种三维纳米结构。几个月前,该研究小组曾造出了一些二维结构,这是又一大的进步,意味着他们从能建造一面墙到可以建造一座房子了。

2012年初,研究小组在《自然》杂志上报告称,他们用DNA砖块(每块长42个碱基,折叠成矩形“砖块”)构造出了二维平面,包括所有罗马字母、标点符号、数字等107个图案,但构建三维结构需要新的“折叠”方法。

新方法用的DNA砖块更小(长度为32个碱基),将每个碱基对砖块转了90度,再将每两个砖块并成立体状,就可以向“上”、向“外”两个方向添砖加瓦了。每8个碱基对(约2.5纳米)构成一个“三维像素”,这是它的最小结构单位,1000个这样的像素构成一个模块,这些模块就成为制作三维建筑的DNA分子“原料块”。研究人员用这些“原料块”制作了102种复杂的三维结构,包括字母、符号、汉字等,不仅表面精巧,还有着复杂的内部洞穴和孔道。

DNA纳米技术的应用

利用DNA纳米结构开发出人工膜通道

在国际著名杂志Science上的一篇研究报告中,来自慕尼黑工业大学和密歇根大学的物理学家揭示了,可以通过一种DNA纳米技术来构建出人工膜通道,这种技术以DNA分子为程序可控的“建筑材料”来构建一系列自我装配、设计开发的纳米级别的特殊结构。这就为未来分子传感器、抗菌制剂等的开发提供了思路。

为了将细胞内环境和外部环境隔开,有机体开发出了相同的屏障:一种由两个脂质分子层所形成的不通透的细胞膜。这项研究中,研究者所开发的人工膜通道完全是由DNA构成的,其具有一系列的应用价值,如果想往细胞中注射某种东西,我们必须在细胞膜上打洞才能完成,然而这种设备可以直接完成这项任务。

DNA纳米结构电化学生物传感器开发成功

中科院上海应用物理研究所、苏州纳米技术与纳米仿生研究所、复旦大学中山医院、上海计量测试技术研究院合作开发了一种基于DNA纳米结构修饰界面 的电化学生物传感器,用于microRNA肿瘤靶标的超灵敏检测。

樊春海研究员及其团队之前已发展了利用三维DNA纳米结构修饰 金电极表面的新方法,可以显着增强表面分子的结合能力和提高检测灵敏度。科研人员将这种DNA纳米结构修饰表面用于microRNA的传感检测。研究表明,这种新型的生物传感器可以检测到 aM(10-18 mol/L)水平(<1000个分子)的microRNAs,具有良好的单碱基区分能力,且能与前体RNA很好地区分。