3月7日 Nature 杂志生物学精选

2013-03-07 09:58 · johnson

3月7日 Nature 杂志生物学精选:科学界的性别歧视;准备降解RNA的“外来体”;小肠上皮中的静态细胞;鸟儿为什么有要唱歌的冲动;生物节律蛋白会选择使用非最佳密码子;古昆虫strashilid并不是恐龙身上的跳蚤;CPEB1蛋白的双重作用。


封面故事:科学界的性别歧视

科学在体制上仍然是存在性别歧视的。尽管取得了一些进步,但与条件相似的男科学家相比,女科学家薪酬仍然较低,晋升机会仍然较少,获得的研究经费资助仍然较少,离开科研工作的可能性仍然较大。本期特刊关注这一性别差异以及为了消除这一差异目前所采取的措施。本期杂志是为了纪念Maxine Clarke。在Maxine 作为Nature杂志的一名编辑为维护最高科学标准而努力奋斗的28年时间里,她经常是惟一提出这样一个问题的人:“女性都在哪里?”

准备降解RNA的“外来体”

负责RNA周转的主要因子是一个被称为“外来体”的含十个亚单元的复合物。这一复合物含有一个活跃的RNase亚单元,即Rrp44。在细胞核中,“外来体”吸收一个辅助因子,后者也是一种核酸酶,即Rrp6。这项研究报告了一个440-kilodalton的复合物的2.8 Å分辨率的晶体结构,它由核心酵母“外来体”、Rrp6的一个羧基端部区域和一个RNA双链组成。该结构显示了RNA是怎样被识别并为降解做好准备的。[论文链接]

小肠上皮中的静态细胞

慢速循环的或静态的干细胞是否与肠腺(肠隐窝)中快速循环的干细胞共存是一个有很大争议的问题。Douglas Winton及其同事利用一个新方法来在活体中跟踪慢速循环的“标记滞留细胞”(LRCs),发现了一组具有专注的Paneth细胞的特征、但仍然表达Lgr5等干细胞标志的LRCs。这些慢速循环的细胞未经细胞分裂而分化成Paneth细胞,但受伤时它们也能重新占据干细胞的位置,帮助所有“肠系”(intestinal lineage)的再生。这项工作表明,静态细胞的确起一个“无性系细胞储备库”的作用,它在肠癌和肠炎的病理中可能起一定作用。[论文链接]

鸟儿为什么有要唱歌的冲动?

“斑胸草雀”等鸟儿发出的复杂叫声需要精确计时的声音控制。关于怎样实现这种计时的一个理论是,HVC(对于鸟叫声的学习和产生来说必不可少的脑区域)中的神经元产生一个“时钟”信号来确定音节长短。Daniel Margoliash及其同事提出了支持另一模型的证据:通过将对禽鸣管进行生物物理模拟与对睡着的和清醒的鸟儿进行录音的方法相结合,他们发现,HVC活动与鸟儿歌唱是精确同步的。这说明,这些神经元不是编码时间,而是采用一个预测性的、“前瞻性”的“感觉运动”(sensorimotor)唱歌(鸣叫)模式。[论文链接]

生物节律蛋白会选择使用非最佳密码子

很多生物学过程是以天为周期有节奏地被调控的,或者说是按节律被调控的。高度表达的基因,如那些调控生物节律的基因,正常情况下包含最佳密码子,使其能够高效表达。现在,来自Carl Johnson实验室和Yi Liu实验室的两项研究发现,蓝细菌和脉孢菌的中央节律蛋白出人意料地使用非最佳密码子,而且对它们的密码子进行优化会使蓝细菌的适应性反应发生变化,影响脉孢菌的生物时钟的功能。这些发现突显了生物节律蛋白是会出乎意料地选择不使用最佳密码子的。[论文链接]

古昆虫strashilid并不是恐龙身上的跳蚤

由于化石标本极少和一些新颖的特点,来自侏罗纪的strashilid化石昆虫过去一般被认为是飞龙或有羽毛恐龙身上类似跳蚤的寄生虫。来自中国侏罗纪中期距今大约1.65亿年的13个新标本的发现彻底改变了这一观点。这些像螯一样、曾被认为是用来向寄主身上附着的腿被发现只见于雄性,更可能是被用来在交配过程中抓雌性的。被认为适于吸血的口器在成年个体中已退化。而且,一些标本还有翅膀和鳃。看来,成年strashilid是水生的或两栖的,在水中出现和交配之后便使自己的翅膀脱落了。[论文链接]

CPEB1蛋白的双重作用

CPEB1(一种 RNA结合蛋白,与信使RNA 3′-UTR多腺苷酸化序列发生相互作用)已知调控细胞质的多腺苷酸化。Raúl Méndez及其同事介绍了它在细胞核中的第二种功能。在细胞核中,CPEB1与剪接因子共同作用,促进很多mRNA中一个上游3′ poly(A)信号的使用,影响另类剪接。因为poly(A)尾巴的缩短已被与增殖和肿瘤发生联系起来,所以这些结果为这一变化是怎样通过由CPEB1将另类多腺苷酸化和另类剪接联系起来实现的提供了一个解释。这种双重功能(即作为翻译调控因子的功能和作为pre-mRNA处理因子的功能)也许意味着,CPEB1能够协调细胞核和细胞质的基因表达调控。[论文链接]