PLoS One:环状RNA在体细胞基因表达中更为普遍

2012-02-03 07:00 · jiexinzhang

据最新研究表明,在人体细胞的基因表达中,环状RNA分子而不是传统的线性分子是普遍的特征。研究成果发表在2月1日在线出版的PLoS ONE杂志上。

PLoS One:环状RNA在体细胞基因表达中更为普遍

传统的基因表达模式是,我们基因组中编译的遗传密码是以RNA分子的形式在各个细胞中表达的,而每一个RNA分子由线性的化学"碱基"串联组成。是时候修正对人类基因表达的传统理解了。据最新研究表明,在人体细胞的基因表达中,环状RNA分子而不是传统的线性分子是普遍的特征。研究成果发表在2月1日在线出版的PLoS ONE杂志上。

霍华休斯医学研究中心的研究人员和斯坦福大学的Patrick Brown教授共同合作,发现数以百计的人类基因转录将RNA分子拼接为环状,而这转录过程似乎是非标准程序。对于许多基因,这些环状RNA占所有转录产物中的相当一部分。这表明环状RNA更为充足,可能比之前认为的更重要。

在此之前环状RNA之所以不在人们的视线之内,是因为传统的细胞中分离RNA的方法不注意的将环状分子丢弃了。环状RNA的准确功能以及潜在的与人体生物学和健康的关联,仍需要进一步研究证实,但是这项研究为更深层次的研究开辟了道路。

这项研究表明,仍有许多重要的基础生物学项目需要结合新的统计学和计算机方法进行探索。Julia Salzman说,他是这篇论文的作者之一。这些环状RNA可能代表一种尚未被发现的生物学过程。


Circular RNAs Are the Predominant Transcript Isoform from Hundreds of Human Genes in Diverse Cell Types

Julia Salzman, Charles Gawad, Peter Lincoln Wang, Norman Lacayo, Patrick O. Brown

Most human pre-mRNAs are spliced into linear molecules that retain the exon order defined by the genomic sequence. By deep sequencing of RNA from a variety of normal and malignant human cells, we found RNA transcripts from many human genes in which the exons were arranged in a non-canonical order. Statistical estimates and biochemical assays provided strong evidence that a substantial fraction of the spliced transcripts from hundreds of genes are circular RNAs. Our results suggest that a non-canonical mode of RNA splicing, resulting in a circular RNA isoform, is a general feature of the gene expression program in human cells.

文献链接:https://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0030733

 

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