NOTCH2基因突变所致Hajdu-Cheney综合征数据挖掘所得

2016-02-02 11:00 · precisionGene

Hajdu-Cheney综合征也称为遗传性骨发育不良并肢端溶骨症,于1948年和1965年分别由Hajdu和Cheney两位放射科医生进行了病例报道。此后的几十例病例既有呈常染色体显性遗传,也有散发病例。NOTCH2基因有34个外显子,且均为常染色体显性遗传,杂合突变即可致病。在实际检测中,此基因出现突变的概率较高,因此,临床判读较为困难。

       

导语: Hajdu-Cheney综合征也称为遗传性骨发育不良并肢端溶骨症,于1948年和1965年分别由Hajdu和Cheney两位放射科医生进行了病例报道。此后的几十例病例既有呈常染色体显性遗传,也有散发病例。

        NOTCH2基因有34个外显子,且均为常染色体显性遗传,杂合突变即可致病。在实际检测中,此基因出现突变的概率较高,因此,临床判读较为困难。

       (OMIM):Hajdu-Cheney syndrome is a rare autosomal dominant skeletal disorder characterized by short stature, coarse and dysmorphic facies, bowing of the long bones, and vertebral anomalies.

       Hajdu-Cheney综合征也称为遗传性骨发育不良并肢端溶骨症,是一种常染色体显性遗传骨骼疾病,特点是身材矮小,面容粗糙畸形,长骨弯曲,脊柱异常。

       NOTCH2基因在相关数据库上主要报道与两种疾病相关。

  1. Hajdu-Cheney syndrome
           此疾病在数据库中有27个条目,都为无义或移码突变,主要集中在2000位氨基酸之后。



       根据protein domain(uniport  https://www.uniprot.org/)信息,NOTCH2基因主要包括三个domain

1). EXTRACELLULAR(26-1677)
2). HELICAL(1678-1698)
3). CYTOPLASMIC(1699-2471)


       其中,2000位氨基酸后包含在CYTOPLASMIC(1699-2471)中,无义或移码突变造成氨基酸长度减少,导致CYTOPLASMIC截短。 因此,Hajdu-Cheney syndrome与CYTOPLASMIC的相关性很高,可以提出假设CYTOPLASMIC区域出现移码或终止突变会导致Hajdu-Cheney syndrome。

       结论:如果临床怀疑Hajdu-Cheney综合征在NOTCH2基因上发现恶性突变,且位于上述区域内时,便可较为肯定的判定该疾病是由此突变导致。反之,则需非常谨慎。

 

2. Alagille syndrome

此疾病在数据库中有10个条目,以错义突变为主,但无明显集中区域

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