目前，为了降低成本，加快时间，大部分癌症基因检测仅分析癌症组织，并不分析生殖细胞DNA。这样做可能会导致误诊误断。本文将就此问题进行一系列的分析探讨。
据美国国家人类基因组研究所（NHGRI）和国家癌症研究所（NCI）的研究表明，仅通过分析癌症组织所得到的变异，其中就可能包含有生殖细胞变异，而这些变异会影响癌症治疗，建议实验室为此做好准备。
临床测序探索研究联合会（CSER）肿瘤工作组得到了NHGRI和NCI资助，其研究人员主要来自密歇根大学、哈佛大学、俄亥俄州立大学、宾夕法尼亚大学、德克萨斯儿童癌症中心和贝勒医学院，他们制定了一系列关于实验室进行癌症测序检测的指南，并将一些建议发表在《国家癌症研究所期刊》（Journal of the National Cancer Institute）上。
据CSER工作组介绍，如果在实验过程中没有特地寻找生殖细胞变异，那么这些变异一旦被鉴定出来，就会对患者及其家属的管理产生影响，因此实验室应该注意这类变异。
本月初，纪念Sloan Kettering癌症中心的研究者报告称，通过使用包含341个基因的panel对肿瘤DNA的分析发现，16%的患者有致病性生殖细胞变异。另外，许多患者所检测出跟癌症风险相关的变异其实也是生殖细胞变异。这些生殖细胞变异也会影响患者的治疗和家属患癌风险的预测。
4月，约翰霍普金斯大学的研究者报告称，在没有与正常样本对照进行分析的时候，3%的患者所鉴定出的肿瘤变异实际是生殖细胞变异。
问题如何解决？
在CSER工作组的一篇文章中，研究人员表示：“不用直接分析生殖细胞DNA，仅从癌症组织测序结果中来识别和推断出生殖细胞变异，这一点能否实现是很重要的。”他们提供了这样的实例和实验室应该考虑的相应问题。
首先，癌症panel中通常包括一些比较公认的遗传性癌症突变基因，例如BRCA1、BRCA2和Lynch综合征的突变基因。
其次，一些变异模式也暗示着潜在的生殖细胞变异。例如，超突变肿瘤中DNA错配修复基因突变通常意味着生殖细胞变异，小儿成神经管细胞瘤中大型染色体重排也暗示着生殖细胞TP53基因变异。
另外，很多基因变异在生殖细胞和体细胞中都能观察到，这类基因通常为癌症易感性基因，包括MSH2、ALK、RB1、TP53和VHL。
生殖细胞变异，临床应格外注意
研究人员介绍，“鉴于变异分析和临床解读相结合的必要性，我们认为，医生和实验室应该共同解决生殖细胞变异的这一问题。”
工作组还建议，为癌症患者进行癌症panel、外显子或全基因组测序分析的实验室应该搭建生物信息学平台，用来鉴定生殖细胞变异。另外，实验室还应该制定适当的策略，用于证实潜在的生殖细胞变异。制定这套策略时应当考虑：如何从患者那里获得生殖细胞样本；实验室自己做检测还是与诊断机构合作。总之，实验室应该为鉴定生殖细胞变异制定一种标准化的方法。
此外，医生也有责任告诉患者，这种基因检测可能会发现遗传性突变，进而会对他们的治疗和家属患癌风险评估产生影响。医生也需要拟定一个方案，如何告诉患者生殖细胞变异的结果。
总而言之，由于基因检测可能会受到生殖细胞变异的影响，医生和实验室应该寻找有效的解决方案，以减少对患者的误诊。
