美国将建十万种食源性致病菌基因组数据库

2012-08-10 08:00 · Hebe

食源性疾病是世界各国的第一号食品安全问题。例如疯牛病,以及具有全球影响的大肠杆菌O157:H7、沙门氏菌等。美国FDA、加州大学戴维斯分校、安捷伦科技公司、美国疾病控制与预防中心(CDC)宣布启动“十万基因组计划”,该项目历时五年,旨在合作创建一个包含10万种食源性致病菌基因组的公共数据库,以加速食源性疾病暴发的细菌鉴定。

美国食品药品监督管理局(FDA)、加利福尼亚州大学戴维斯分校、安捷伦科技公司、美国疾病控制与预防中心(CDC)宣布启动“十万基因组计划”,该项目历时五年,旨在合作创建一个包含10万种食源性致病菌基因组的公共数据库,以加速食源性疾病暴发的细菌鉴定。

该计划将对约10 万种重要的食源性致病菌(包括沙门氏菌、李斯特菌和大肠杆菌等重要的致病菌)测序,并将测序信息序储存在美国国立卫生研究院下属的国家生物技术信息中心(NCBI)的公共数据库。该数据库将开放访问,提供能鉴定病原体及其来源的检测方法。一旦暴发食源性疾病,该类检测有可能在几天甚至是几小时内展开公共卫生应对,而不是传统的几周内,从而显著减少公共卫生应对时间。

在该项目中,测序工作将由加州大学戴维斯分校协调完成,该校同时还开放其收集的细菌样本库;FDA提供500 多份已完成的沙门氏菌全基因组序列草图,提供数千份其他种重要的食源性病原体供测序,并提供生物信息学支持,其科学家们也将在需要时指导该项目并提供技术支援;安捷伦提供专业知识、设备、仪器和资金支持加州大学戴维斯分校测序;CDC 将提供食源性疾病的专业知识,提供菌株供测序,并提供该项目所需要的其他信息,CDC 专家还将参与到项目指导委员会。

“这一举措对于食源性疾病的监控和疫情的快速反应有极大的好处,并有助于我们追查食源性疾病爆发可能的潜在来源。”美国农业部食品安全局(FSIS)伊丽莎白·哈根博士说,“我们期待着这个公共数据库可以给联邦、州和地方公共卫生机构带来方便。”

扩展阅读:

食源性疾病是世界各国的第一号食品安全问题。例如疯牛病,以及具有全球影响的大肠杆菌O157:H7、沙门氏菌、李斯特菌引起的大规模食物中毒暴发可视为有代表性的食源性疾病。世界卫生组织(WHO)将食源性疾病定义为“因通过食物进入人体的各种致病因素引起的、通常具有感染性质或中毒性质的一类疾病(foodborne illness)”。

引起食源性疾病的主要病原生物有细菌(如,沙门氏菌、痢疾、致病性大肠杆菌)、病毒(如,甲型肝炎病毒、轮状病毒)和寄生虫(如,蛔虫、肝吸虫、绦虫)。罹患这些疾病时,轻者呕吐、腹痛、轻度腹泻,重者发烧、休克,乃至死亡。若有两个或两个以上的人在食用同一种食物后患上类似疾病,则称为食源性疾病暴发,在我国则称为“食物中毒”。

食源性疾病不但危及消费者健康和生命,而且对个人、单位和社会造成不同程度的经济损失,包括医疗费用、致残而失业、劳动能力下降等。因此,世界各国均将食源性疾病作为最重要的食品安全问题。发展中国家由于卫生条件差、生产落后、生产经营者素质差,从而使得食源性疾病更常见;即便是发达国家,这也是政府最关注的食品安全问题。

据世界卫生组织估计,食源性疾病报告的漏报率在发达国家为90%,而在发展中国家约为95%~99%。美国疾病预防控制中心(CDC)为了掌握食源性疾病的实际发生率,在全国不同地区设立了若干监测点,对食源性疾病进行主动监测,然后用监测点的数据来估算全国的发病数。根据这样的主动监测结果,美国疾病预防控制中心估计,全美国每年有大约7000多万人次患食源性疾病(每三个人中有一个人次),32.5万人住院,5000人死亡。而我国,卫生部每年通常收到食物中毒报告600~800起,发病2~3万人,死亡200~300人。这并不表明我国食源性疾病的发生数量少于美国;相反的,这说明我国的食源性疾病漏报率高得惊人。