有史以来,法罗群岛是第一个准备对全部人口进行基因组测序的地区,FarGen项目可能成为全球范围内个性化医疗的模式。
法罗群岛打算对全部人口进行基因组测序
法罗群岛
法罗群岛是一个令人兴奋和具有挑战性的旅游目的地,但是,由于人口组成的同源性和长期记载的遗传家谱,法罗群岛在人口上表现出单一性,这一背景将用于测序全部人口的基因组图谱。
FarGen将成为世界上第一个绘制全部人口基因组图谱的项目,有望把基于基因组的个体化医疗带到法罗群岛。
在哥本哈根举行的International Conference Copenhagenomics会议上,Bogi称:“这是一个全社会共有的工程,我们将创造的不只是一个遗传生物资料库,而且是一个完全新的卫生系统。”
FarGen项目的主管Eliasen称:“该项目将解决法罗群岛独特的遗传问题,并在全球范围内引领这一方向。”
丹麦科学家异常兴奋
奥胡斯大学Skejby医学院分子诊断室 Torben Ørntoft 教授称:“这是一个令人兴奋的项目,它成为世界各地效仿的一个范例。这一目标是正确的,丹麦也会这样做,5年内,我们将绘制国有医院所有病人的遗传图谱。”
医生能够通过基因组数据库查阅病人的遗传图谱,进而确定特定药物是否具有副作用,或者确定对于遗传疾病的预防治疗是否正确。
奥胡斯大学生物医学研究所教授Donald Børglum认为,“全球范围内多数科学家一起参与这一领域,对于法罗群岛而言,它却是一件相对简单的事,因为法罗群岛的优势体现在:它能够发现遗传与疾病之间的关联以及潜在的疾病机制。从长远来看,该项目能够提供更好地、更有针对性的治疗。”
Børglum补充道:“丹麦也有一个被称为丹麦基因组的类似项目,计划到2015年,他和同事将绘制150位丹麦人的起始遗传图谱。”
新技术让基因组图谱的绘制更便宜
当今科学界,基因组测序是一个热门词汇。自十多年前第一个人类基因组测序完成以来,测序技术已获得快速发展,测序成本大幅下降以及测序速度呈现“井喷”之势。这些都促使个人基因组测序的费用降到€3,000以下。
在测序价格下降的基础上,法罗群岛的全民基因组测序项目变得可行。据统计,法罗群岛人口数约为5万。
改善公众健康
FarGen项目类似于冰岛在20世纪90年代末推出解码基因组项目,不过,后者是一个商业项目,它仅测序冰岛代表人群的样本,迄今尚未开发出新药物。
另一方面,政府出资的FarGen项目旨在对全部人口的基因组进行测序,有望在改善公众健康中发挥了关键作用。
当法罗群岛人口被用作对照人群时,解码基因组项目引发激烈的争论。事后,该项目没有取得任何结果,而那场争辩却播下一些思想,如2005年提出的用于保护个人的新遗传遗传调控体系。
法罗群岛的人口
法罗群岛人口最引人之处是高度的同质性。多数人群对祖先的了解可追溯到17世纪50年代,有的甚至可追溯到维京人时期(大约在1000年前踏上这一岛屿)。该岛屿具有一个共同的家谱,在时间上可回溯200年,因而能简单地确定疾病相关的遗传因素。
据Eliasen称:“对于孤立人口而言,完整的人口组成是有趣的和重要的,因为它能够研究不同遗传因子的共同来源。法罗群岛是一个结构紧凑、同质性的小型社会,具有广泛的数字医疗系统、大量的健康数据以及至少2005年以来的遗传调控体系。”
法罗群岛上基因图谱的时间表
1998年:解码基因组项目希望将法罗群岛人口作为对照人群
1998年 - 2006年:法罗群岛的激烈辩论
2005年:法罗群岛遗传生物资料库建立
2007年: FarGen研究项目启动
2009 - 2012年:FarGen框架开发
2012年:开始测序
总之,法罗群岛定位于全民基因组测序的举动必将成为世界各地效仿的范例。
灵感来自诺贝尔文学奖得主
测序技术已准备就绪,但它需要在可控制的范围内进行尝试和测试。对于这一目的,法罗群岛成为世界上唯一适合的地方。
据Eliasen称,国际科学家提出这一想法,FarGen项目目前拥有一个在基因组研究领域列于前10的科学顾问团,诺贝尔奖得主 James Watson(曾领导人类国际基因组工程)是灵感主要来源之一。该计划负责人称,他们现在已准备好测序起始100人的样本,之后将测序 5000个基因组(这一计划预计将于2013年底完成),最终,余下的人口将常规化进行测序,包括新生儿。不过,估计 €270,000-400,000的经费目前还未筹集完成。
法罗群岛独特疾病的研究
医生能够通过基因组数据库查阅病人的遗传图谱,进而确定特定药物是否具有副作用,或者确定对于遗传疾病的预防治疗是否正确。
法罗群岛的概况
法罗群岛是北欧国家丹麦的海外自治领地。地理位置介乎挪威海和北大西洋中间,处于挪威到冰岛之间距离一半的位置。法罗群岛陆地面积1399平方公里,由17个有人岛和若干个无人岛组成,居民多为斯堪的纳维亚人后代,基督教路德会的教友,官方语言为法罗语和丹麦语。