今年3月曝出的“山东非法经营疫苗案”已过去数月，除了相关责任人的处罚结果尚未公布外，在此次黑天鹅事件中受重创的国内疫苗企业何时能走出阴影也不得而知。
智飞生物和沃森生物先后于7月10日和7月14日发布了惨淡的2016年半年度业绩预告。
智飞生物在2016半年业绩预告公告中称：“公司2016年疫苗产品销售开局良好，第一季度实现净利润5919.84万元。但受3月18日爆发的“山东疫苗事件”的影响，我国疫苗行业政策发生变化，疫苗行业受到了较大程度的影响，疫苗产品销售大幅下降，短期内对公司产品的销售造成了较大的影响，与去年同期相比，1~6月归属于上市公司股东的净利润预计同比下滑85%~100%。”
智飞生物2015上半年盈利为1.08亿元，今年上半年的盈利预计为0~1621.8万元，属于一不小心就亏损的状态。与智飞生物相比，受山东疫苗案牵连更深的沃森生物的2016上半年业绩更加惨不忍睹。
根据沃森生物发布的2016年半年业绩预告，沃森生物2015年上半年亏损6712.49万元，今年上半年的亏损额预计高达1.5亿~1.55亿元。
虽然沃森生物解释称报告期内出现亏损的原因还在于公司继续加大对新产品研发，注册及临床研究的投入导致管理费用增加，以及支付中期票据利息形成的财务费用金额较大，但毫无疑问的是，沃森生物2013年以3亿元重金收购的实杰生物因山东疫苗案被撤销GSP认证并从新三板退市，以及国家后续出台新修改的《疫苗流通和预防接种管理条例》一下子让沃森生物失去了业绩支撑，对其造成了重创。
山东疫苗案曝发后，疫苗生产企业的产品销售受到了影响，最直接的冲击来自于国务院4月23日通过的《国务院关于修改〈疫苗流通和预防接种管理条例〉的决定》，对疫苗的采购、配送、储存、流向追溯、安全问题处罚问责制度进行了改革。
其中最大的变化就是取消药品批发企业的二类疫苗经营权，将疫苗的采购全部纳入省级公共资源交易平台。一类疫苗维持原来的省级疾控机构采购和逐级分发，二类疫苗由生产企业直接向县级疾控机构配送，再由县级疾控机构供给接种单位。这对相关疫苗生产企业的销售直接产生了影响。
市场上二类疫苗遭遇断货危机
在国务院对《疫苗流通和预防接种管理条例》进行修改后，二类疫苗的流通销售一下子收紧，市场上不时传来二类疫苗断货的传闻。
7月8日，CFDA发布了关于做好疫苗供应工作的通知。通知中介绍，根据基层反映的情况，近期部分疫苗出现供应短缺和销售量大幅下滑的问题，引发公众对疫苗供应不足的担心。国家食药监总局要求各地监管部门督促引导疫苗生产企业严格按计划组织生产，不得因暂时性销售困难随意减产或停产，影响疫苗的正常供应和接种工作。
另据国家食药监总局7月8日公布的数据，2015年我国疫苗批签发量约为52025.92万瓶（支），今年上半年该值为24772.85万瓶（支）。相比去年同期的疫苗批签发总量没有太大变化。
有疫苗行业分析人士表示：“政策的变化使得大批从事疫苗经营的企业“受伤”严重，也让依靠疫苗经营企业进行销售的疫苗生产企业不知所措。因为很多疫苗生产企业无法做到直接将疫苗配送到各县级疾控机构，为此不得不中断二类疫苗销售的情况也在预料之中”。
不过按照CFDA的新规定，疫苗生产企业的产品销售应该会逐渐恢复。
